Protein–RNA interactions for Protein: E9PUP1

Syde2, Synapse defective 1, Rho GTPase, homolog 2 (C. elegans), mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde2E9PUP1 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Syde2E9PUP1 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syde2E9PUP1 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Syde2E9PUP1 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syde2E9PUP1 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syde2E9PUP1 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syde2E9PUP1 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syde2E9PUP1 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syde2E9PUP1 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syde2E9PUP1 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syde2E9PUP1 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syde2E9PUP1 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syde2E9PUP1 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Syde2E9PUP1 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syde2E9PUP1 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syde2E9PUP1 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syde2E9PUP1 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syde2E9PUP1 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syde2E9PUP1 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syde2E9PUP1 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Syde2E9PUP1 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Syde2E9PUP1 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syde2E9PUP1 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syde2E9PUP1 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syde2E9PUP1 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syde2E9PUP1 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syde2E9PUP1 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syde2E9PUP1 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syde2E9PUP1 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syde2E9PUP1 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syde2E9PUP1 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syde2E9PUP1 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syde2E9PUP1 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syde2E9PUP1 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Syde2E9PUP1 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Syde2E9PUP1 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syde2E9PUP1 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Syde2E9PUP1 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Syde2E9PUP1 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syde2E9PUP1 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syde2E9PUP1 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Syde2E9PUP1 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syde2E9PUP1 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syde2E9PUP1 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syde2E9PUP1 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syde2E9PUP1 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syde2E9PUP1 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syde2E9PUP1 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syde2E9PUP1 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syde2E9PUP1 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syde2E9PUP1 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syde2E9PUP1 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syde2E9PUP1 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syde2E9PUP1 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syde2E9PUP1 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syde2E9PUP1 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syde2E9PUP1 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Syde2E9PUP1 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syde2E9PUP1 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syde2E9PUP1 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syde2E9PUP1 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syde2E9PUP1 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syde2E9PUP1 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syde2E9PUP1 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syde2E9PUP1 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syde2E9PUP1 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syde2E9PUP1 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syde2E9PUP1 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syde2E9PUP1 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syde2E9PUP1 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syde2E9PUP1 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syde2E9PUP1 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Syde2E9PUP1 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syde2E9PUP1 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syde2E9PUP1 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syde2E9PUP1 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syde2E9PUP1 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syde2E9PUP1 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syde2E9PUP1 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Syde2E9PUP1 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syde2E9PUP1 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syde2E9PUP1 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syde2E9PUP1 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Syde2E9PUP1 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syde2E9PUP1 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syde2E9PUP1 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syde2E9PUP1 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Syde2E9PUP1 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Syde2E9PUP1 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Syde2E9PUP1 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Syde2E9PUP1 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Syde2E9PUP1 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Syde2E9PUP1 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Syde2E9PUP1 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Syde2E9PUP1 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Syde2E9PUP1 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Syde2E9PUP1 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Syde2E9PUP1 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Syde2E9PUP1 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Syde2E9PUP1 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59 ms