Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms