Protein–RNA interactions for Protein: D3YYH9

Gm498, Predicted gene 498, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm498D3YYH9 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm498D3YYH9 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm498D3YYH9 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm498D3YYH9 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm498D3YYH9 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm498D3YYH9 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm498D3YYH9 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm498D3YYH9 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm498D3YYH9 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm498D3YYH9 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm498D3YYH9 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm498D3YYH9 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm498D3YYH9 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm498D3YYH9 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm498D3YYH9 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm498D3YYH9 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm498D3YYH9 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm498D3YYH9 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm498D3YYH9 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm498D3YYH9 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm498D3YYH9 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm498D3YYH9 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm498D3YYH9 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm498D3YYH9 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm498D3YYH9 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm498D3YYH9 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm498D3YYH9 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm498D3YYH9 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm498D3YYH9 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm498D3YYH9 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm498D3YYH9 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm498D3YYH9 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm498D3YYH9 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm498D3YYH9 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm498D3YYH9 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm498D3YYH9 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm498D3YYH9 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm498D3YYH9 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm498D3YYH9 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm498D3YYH9 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm498D3YYH9 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm498D3YYH9 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm498D3YYH9 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm498D3YYH9 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm498D3YYH9 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm498D3YYH9 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm498D3YYH9 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm498D3YYH9 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm498D3YYH9 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm498D3YYH9 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm498D3YYH9 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm498D3YYH9 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm498D3YYH9 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm498D3YYH9 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm498D3YYH9 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm498D3YYH9 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm498D3YYH9 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm498D3YYH9 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm498D3YYH9 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm498D3YYH9 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm498D3YYH9 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm498D3YYH9 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm498D3YYH9 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm498D3YYH9 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm498D3YYH9 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm498D3YYH9 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm498D3YYH9 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm498D3YYH9 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm498D3YYH9 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm498D3YYH9 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm498D3YYH9 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm498D3YYH9 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm498D3YYH9 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm498D3YYH9 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm498D3YYH9 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm498D3YYH9 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm498D3YYH9 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm498D3YYH9 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm498D3YYH9 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm498D3YYH9 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm498D3YYH9 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm498D3YYH9 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm498D3YYH9 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm498D3YYH9 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm498D3YYH9 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm498D3YYH9 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm498D3YYH9 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm498D3YYH9 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm498D3YYH9 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm498D3YYH9 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm498D3YYH9 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm498D3YYH9 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm498D3YYH9 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm498D3YYH9 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm498D3YYH9 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm498D3YYH9 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm498D3YYH9 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm498D3YYH9 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm498D3YYH9 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm498D3YYH9 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms