Protein–RNA interactions for Protein: A2CFD5

Btbd35f28, BTB domain-containing 35, family member 28, mousemouse

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Btbd35f28A2CFD5 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Btbd35f28A2CFD5 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Btbd35f28A2CFD5 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Btbd35f28A2CFD5 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Btbd35f28A2CFD5 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Btbd35f28A2CFD5 Trim61-201ENSMUST00000078409 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Btbd35f28A2CFD5 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Btbd35f28A2CFD5 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Btbd35f28A2CFD5 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Btbd35f28A2CFD5 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Btbd35f28A2CFD5 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Btbd35f28A2CFD5 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Btbd35f28A2CFD5 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Btbd35f28A2CFD5 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Btbd35f28A2CFD5 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Btbd35f28A2CFD5 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Btbd35f28A2CFD5 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Btbd35f28A2CFD5 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Btbd35f28A2CFD5 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Btbd35f28A2CFD5 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC11□□□□□ -0.65
Btbd35f28A2CFD5 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Btbd35f28A2CFD5 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Btbd35f28A2CFD5 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Btbd35f28A2CFD5 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Btbd35f28A2CFD5 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Btbd35f28A2CFD5 Pck2-201ENSMUST00000048781 3400 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Btbd35f28A2CFD5 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Btbd35f28A2CFD5 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Btbd35f28A2CFD5 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Btbd35f28A2CFD5 Gm12333-201ENSMUST00000155508 2669 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Btbd35f28A2CFD5 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Btbd35f28A2CFD5 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Btbd35f28A2CFD5 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Btbd35f28A2CFD5 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Btbd35f28A2CFD5 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Btbd35f28A2CFD5 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Btbd35f28A2CFD5 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Btbd35f28A2CFD5 Tnip1-206ENSMUST00000108889 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Btbd35f28A2CFD5 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Btbd35f28A2CFD5 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Btbd35f28A2CFD5 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Btbd35f28A2CFD5 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Btbd35f28A2CFD5 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Btbd35f28A2CFD5 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Btbd35f28A2CFD5 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Btbd35f28A2CFD5 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Btbd35f28A2CFD5 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Btbd35f28A2CFD5 Timd4-201ENSMUST00000068877 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Btbd35f28A2CFD5 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Btbd35f28A2CFD5 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Btbd35f28A2CFD5 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Btbd35f28A2CFD5 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Btbd35f28A2CFD5 Gm10646-201ENSMUST00000213227 3293 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Btbd35f28A2CFD5 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Btbd35f28A2CFD5 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Btbd35f28A2CFD5 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Btbd35f28A2CFD5 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Btbd35f28A2CFD5 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Btbd35f28A2CFD5 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Btbd35f28A2CFD5 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Btbd35f28A2CFD5 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Btbd35f28A2CFD5 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Btbd35f28A2CFD5 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Btbd35f28A2CFD5 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Btbd35f28A2CFD5 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Btbd35f28A2CFD5 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Btbd35f28A2CFD5 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Btbd35f28A2CFD5 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Btbd35f28A2CFD5 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Btbd35f28A2CFD5 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Btbd35f28A2CFD5 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Btbd35f28A2CFD5 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Btbd35f28A2CFD5 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Btbd35f28A2CFD5 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Btbd35f28A2CFD5 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Btbd35f28A2CFD5 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Btbd35f28A2CFD5 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Btbd35f28A2CFD5 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Btbd35f28A2CFD5 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Btbd35f28A2CFD5 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Btbd35f28A2CFD5 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Btbd35f28A2CFD5 Gm43375-201ENSMUST00000196705 2480 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Btbd35f28A2CFD5 Olfr1113-202ENSMUST00000215611 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Btbd35f28A2CFD5 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Btbd35f28A2CFD5 Dok4-204ENSMUST00000212810 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Btbd35f28A2CFD5 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Btbd35f28A2CFD5 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Btbd35f28A2CFD5 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Btbd35f28A2CFD5 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Btbd35f28A2CFD5 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Btbd35f28A2CFD5 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Btbd35f28A2CFD5 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Btbd35f28A2CFD5 Usp2-203ENSMUST00000114830 2122 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Btbd35f28A2CFD5 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Btbd35f28A2CFD5 Tmcc2-201ENSMUST00000045473 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Btbd35f28A2CFD5 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Btbd35f28A2CFD5 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Btbd35f28A2CFD5 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Btbd35f28A2CFD5 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Btbd35f28A2CFD5 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms