Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rtf1A2AQ19 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rtf1A2AQ19 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rtf1A2AQ19 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rtf1A2AQ19 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rtf1A2AQ19 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rtf1A2AQ19 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rtf1A2AQ19 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rtf1A2AQ19 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rtf1A2AQ19 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rtf1A2AQ19 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rtf1A2AQ19 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rtf1A2AQ19 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rtf1A2AQ19 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rtf1A2AQ19 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rtf1A2AQ19 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rtf1A2AQ19 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rtf1A2AQ19 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rtf1A2AQ19 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rtf1A2AQ19 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rtf1A2AQ19 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rtf1A2AQ19 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rtf1A2AQ19 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rtf1A2AQ19 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rtf1A2AQ19 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rtf1A2AQ19 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rtf1A2AQ19 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rtf1A2AQ19 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rtf1A2AQ19 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rtf1A2AQ19 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rtf1A2AQ19 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rtf1A2AQ19 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Rtf1A2AQ19 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rtf1A2AQ19 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rtf1A2AQ19 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rtf1A2AQ19 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rtf1A2AQ19 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rtf1A2AQ19 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rtf1A2AQ19 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rtf1A2AQ19 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rtf1A2AQ19 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rtf1A2AQ19 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rtf1A2AQ19 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rtf1A2AQ19 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rtf1A2AQ19 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rtf1A2AQ19 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rtf1A2AQ19 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rtf1A2AQ19 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rtf1A2AQ19 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rtf1A2AQ19 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rtf1A2AQ19 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rtf1A2AQ19 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rtf1A2AQ19 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rtf1A2AQ19 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rtf1A2AQ19 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rtf1A2AQ19 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rtf1A2AQ19 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rtf1A2AQ19 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rtf1A2AQ19 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rtf1A2AQ19 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rtf1A2AQ19 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rtf1A2AQ19 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rtf1A2AQ19 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rtf1A2AQ19 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rtf1A2AQ19 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rtf1A2AQ19 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rtf1A2AQ19 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rtf1A2AQ19 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rtf1A2AQ19 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rtf1A2AQ19 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rtf1A2AQ19 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rtf1A2AQ19 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rtf1A2AQ19 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rtf1A2AQ19 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rtf1A2AQ19 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rtf1A2AQ19 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rtf1A2AQ19 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rtf1A2AQ19 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rtf1A2AQ19 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rtf1A2AQ19 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rtf1A2AQ19 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rtf1A2AQ19 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rtf1A2AQ19 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rtf1A2AQ19 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rtf1A2AQ19 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rtf1A2AQ19 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rtf1A2AQ19 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rtf1A2AQ19 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rtf1A2AQ19 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rtf1A2AQ19 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rtf1A2AQ19 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rtf1A2AQ19 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rtf1A2AQ19 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rtf1A2AQ19 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rtf1A2AQ19 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rtf1A2AQ19 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rtf1A2AQ19 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rtf1A2AQ19 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rtf1A2AQ19 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rtf1A2AQ19 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms