Protein–RNA interactions for Protein: A2AH22

Ambra1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, mousemouse

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Length 1,300 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ambra1A2AH22 Spata3-201ENSMUST00000052854 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ambra1A2AH22 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ambra1A2AH22 Gm43334-201ENSMUST00000197740 1318 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ambra1A2AH22 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ambra1A2AH22 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ambra1A2AH22 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ambra1A2AH22 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ambra1A2AH22 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ambra1A2AH22 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ambra1A2AH22 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ambra1A2AH22 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ambra1A2AH22 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ambra1A2AH22 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ambra1A2AH22 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ambra1A2AH22 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ambra1A2AH22 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ambra1A2AH22 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ambra1A2AH22 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ambra1A2AH22 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ambra1A2AH22 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ambra1A2AH22 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ambra1A2AH22 Gm25053-201ENSMUST00000103982 133 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ambra1A2AH22 Gm25922-201ENSMUST00000104281 130 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ambra1A2AH22 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ambra1A2AH22 Gm7541-201ENSMUST00000118361 535 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ambra1A2AH22 Asgr1-205ENSMUST00000146411 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ambra1A2AH22 Gm24679-201ENSMUST00000158762 111 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ambra1A2AH22 Gm25053-202ENSMUST00000199731 132 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ambra1A2AH22 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ambra1A2AH22 AC113282.2-201ENSMUST00000224012 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ambra1A2AH22 AC113282.3-201ENSMUST00000224757 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ambra1A2AH22 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ambra1A2AH22 Olfr1339-201ENSMUST00000094832 948 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ambra1A2AH22 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ambra1A2AH22 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ambra1A2AH22 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ambra1A2AH22 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ambra1A2AH22 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ambra1A2AH22 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ambra1A2AH22 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ambra1A2AH22 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ambra1A2AH22 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ambra1A2AH22 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ambra1A2AH22 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ambra1A2AH22 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ambra1A2AH22 2610301B20Rik-202ENSMUST00000101504 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ambra1A2AH22 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ambra1A2AH22 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ambra1A2AH22 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ambra1A2AH22 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ambra1A2AH22 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ambra1A2AH22 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ambra1A2AH22 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ambra1A2AH22 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ambra1A2AH22 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ambra1A2AH22 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ambra1A2AH22 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ambra1A2AH22 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ambra1A2AH22 Gm14807-201ENSMUST00000116640 983 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ambra1A2AH22 Gm24248-201ENSMUST00000157321 322 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ambra1A2AH22 Gm8723-201ENSMUST00000166076 820 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ambra1A2AH22 Gm8701-201ENSMUST00000169259 874 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ambra1A2AH22 Gm21844-201ENSMUST00000178699 663 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ambra1A2AH22 Mir6923-201ENSMUST00000184592 72 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ambra1A2AH22 Iqcf3-202ENSMUST00000186668 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ambra1A2AH22 Gm9884-201ENSMUST00000194343 1222 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ambra1A2AH22 Gm42816-201ENSMUST00000198433 325 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ambra1A2AH22 Mpv17-206ENSMUST00000201353 846 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ambra1A2AH22 Fkbp6-204ENSMUST00000201791 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ambra1A2AH22 Gm4065-202ENSMUST00000218911 986 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ambra1A2AH22 Pcgf5-204ENSMUST00000224772 1266 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ambra1A2AH22 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ambra1A2AH22 Gm4604-201ENSMUST00000025040 390 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ambra1A2AH22 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ambra1A2AH22 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ambra1A2AH22 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ambra1A2AH22 Rnf133-202ENSMUST00000115354 1333 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ambra1A2AH22 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ambra1A2AH22 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ambra1A2AH22 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ambra1A2AH22 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ambra1A2AH22 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ambra1A2AH22 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ambra1A2AH22 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ambra1A2AH22 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ambra1A2AH22 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ambra1A2AH22 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ambra1A2AH22 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ambra1A2AH22 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ambra1A2AH22 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ambra1A2AH22 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ambra1A2AH22 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ambra1A2AH22 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ambra1A2AH22 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ambra1A2AH22 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ambra1A2AH22 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ambra1A2AH22 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ambra1A2AH22 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ambra1A2AH22 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ambra1A2AH22 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
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