Protein–RNA interactions for Protein: A2AGD7

Ccdc163, Coiled-coil domain-containing 163, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc163A2AGD7 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccdc163A2AGD7 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccdc163A2AGD7 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccdc163A2AGD7 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccdc163A2AGD7 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccdc163A2AGD7 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccdc163A2AGD7 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccdc163A2AGD7 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccdc163A2AGD7 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccdc163A2AGD7 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccdc163A2AGD7 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccdc163A2AGD7 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccdc163A2AGD7 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccdc163A2AGD7 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccdc163A2AGD7 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccdc163A2AGD7 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccdc163A2AGD7 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccdc163A2AGD7 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccdc163A2AGD7 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccdc163A2AGD7 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccdc163A2AGD7 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccdc163A2AGD7 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccdc163A2AGD7 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccdc163A2AGD7 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccdc163A2AGD7 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccdc163A2AGD7 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccdc163A2AGD7 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccdc163A2AGD7 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccdc163A2AGD7 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccdc163A2AGD7 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccdc163A2AGD7 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccdc163A2AGD7 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccdc163A2AGD7 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccdc163A2AGD7 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccdc163A2AGD7 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccdc163A2AGD7 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccdc163A2AGD7 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccdc163A2AGD7 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccdc163A2AGD7 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccdc163A2AGD7 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccdc163A2AGD7 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccdc163A2AGD7 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccdc163A2AGD7 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccdc163A2AGD7 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccdc163A2AGD7 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccdc163A2AGD7 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccdc163A2AGD7 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccdc163A2AGD7 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccdc163A2AGD7 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccdc163A2AGD7 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccdc163A2AGD7 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccdc163A2AGD7 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccdc163A2AGD7 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccdc163A2AGD7 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccdc163A2AGD7 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccdc163A2AGD7 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccdc163A2AGD7 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccdc163A2AGD7 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccdc163A2AGD7 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccdc163A2AGD7 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccdc163A2AGD7 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccdc163A2AGD7 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccdc163A2AGD7 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccdc163A2AGD7 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccdc163A2AGD7 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccdc163A2AGD7 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccdc163A2AGD7 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccdc163A2AGD7 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccdc163A2AGD7 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccdc163A2AGD7 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccdc163A2AGD7 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccdc163A2AGD7 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccdc163A2AGD7 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccdc163A2AGD7 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccdc163A2AGD7 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccdc163A2AGD7 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccdc163A2AGD7 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccdc163A2AGD7 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccdc163A2AGD7 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccdc163A2AGD7 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccdc163A2AGD7 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccdc163A2AGD7 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccdc163A2AGD7 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccdc163A2AGD7 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccdc163A2AGD7 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccdc163A2AGD7 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccdc163A2AGD7 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccdc163A2AGD7 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccdc163A2AGD7 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccdc163A2AGD7 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccdc163A2AGD7 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccdc163A2AGD7 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccdc163A2AGD7 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ccdc163A2AGD7 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ccdc163A2AGD7 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ccdc163A2AGD7 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Ccdc163A2AGD7 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ccdc163A2AGD7 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ccdc163A2AGD7 AC107453.4-201ENSMUST00000227068 1817 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Ccdc163A2AGD7 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms