Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V5

Hdac6, Histone deacetylase 6, mousemouse

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Length 1,149 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac6Q9Z2V5 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hdac6Q9Z2V5 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hdac6Q9Z2V5 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hdac6Q9Z2V5 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hdac6Q9Z2V5 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hdac6Q9Z2V5 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hdac6Q9Z2V5 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hdac6Q9Z2V5 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hdac6Q9Z2V5 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hdac6Q9Z2V5 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hdac6Q9Z2V5 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hdac6Q9Z2V5 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hdac6Q9Z2V5 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hdac6Q9Z2V5 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Hdac6Q9Z2V5 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Hdac6Q9Z2V5 Gm20714-202ENSMUST00000176436 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hdac6Q9Z2V5 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
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Hdac6Q9Z2V5 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Hdac6Q9Z2V5 Gm42518-201ENSMUST00000196277 938 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Hdac6Q9Z2V5 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hdac6Q9Z2V5 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Hdac6Q9Z2V5 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hdac6Q9Z2V5 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hdac6Q9Z2V5 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hdac6Q9Z2V5 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hdac6Q9Z2V5 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hdac6Q9Z2V5 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hdac6Q9Z2V5 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hdac6Q9Z2V5 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hdac6Q9Z2V5 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hdac6Q9Z2V5 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hdac6Q9Z2V5 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hdac6Q9Z2V5 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hdac6Q9Z2V5 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hdac6Q9Z2V5 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Hdac6Q9Z2V5 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hdac6Q9Z2V5 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hdac6Q9Z2V5 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hdac6Q9Z2V5 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hdac6Q9Z2V5 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hdac6Q9Z2V5 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Hdac6Q9Z2V5 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hdac6Q9Z2V5 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hdac6Q9Z2V5 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hdac6Q9Z2V5 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hdac6Q9Z2V5 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hdac6Q9Z2V5 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hdac6Q9Z2V5 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Hdac6Q9Z2V5 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Hdac6Q9Z2V5 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Hdac6Q9Z2V5 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hdac6Q9Z2V5 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hdac6Q9Z2V5 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Hdac6Q9Z2V5 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hdac6Q9Z2V5 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Hdac6Q9Z2V5 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hdac6Q9Z2V5 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hdac6Q9Z2V5 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hdac6Q9Z2V5 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hdac6Q9Z2V5 Bri3-202ENSMUST00000110695 669 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hdac6Q9Z2V5 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Hdac6Q9Z2V5 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hdac6Q9Z2V5 Gm3671-201ENSMUST00000182463 1007 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Hdac6Q9Z2V5 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Hdac6Q9Z2V5 Gm19166-201ENSMUST00000196041 1063 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Hdac6Q9Z2V5 AC124457.1-201ENSMUST00000198845 120 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Hdac6Q9Z2V5 Gm3793-201ENSMUST00000204973 672 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Hdac6Q9Z2V5 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Hdac6Q9Z2V5 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hdac6Q9Z2V5 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hdac6Q9Z2V5 AC166341.2-201ENSMUST00000220571 120 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Hdac6Q9Z2V5 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hdac6Q9Z2V5 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hdac6Q9Z2V5 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hdac6Q9Z2V5 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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