Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0Z3

Skp2, S-phase kinase-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skp2Q9Z0Z3 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Skp2Q9Z0Z3 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Skp2Q9Z0Z3 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Skp2Q9Z0Z3 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Skp2Q9Z0Z3 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Skp2Q9Z0Z3 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Skp2Q9Z0Z3 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Skp2Q9Z0Z3 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Skp2Q9Z0Z3 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Skp2Q9Z0Z3 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Skp2Q9Z0Z3 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Skp2Q9Z0Z3 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Skp2Q9Z0Z3 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Skp2Q9Z0Z3 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Skp2Q9Z0Z3 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Skp2Q9Z0Z3 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Skp2Q9Z0Z3 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Skp2Q9Z0Z3 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Skp2Q9Z0Z3 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Skp2Q9Z0Z3 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Skp2Q9Z0Z3 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Skp2Q9Z0Z3 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Skp2Q9Z0Z3 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Skp2Q9Z0Z3 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Skp2Q9Z0Z3 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Skp2Q9Z0Z3 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Skp2Q9Z0Z3 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Skp2Q9Z0Z3 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Skp2Q9Z0Z3 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Skp2Q9Z0Z3 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Skp2Q9Z0Z3 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Skp2Q9Z0Z3 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Skp2Q9Z0Z3 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Skp2Q9Z0Z3 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Skp2Q9Z0Z3 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Skp2Q9Z0Z3 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Skp2Q9Z0Z3 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Skp2Q9Z0Z3 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Skp2Q9Z0Z3 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Skp2Q9Z0Z3 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Skp2Q9Z0Z3 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Skp2Q9Z0Z3 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Skp2Q9Z0Z3 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Skp2Q9Z0Z3 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Skp2Q9Z0Z3 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Skp2Q9Z0Z3 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Skp2Q9Z0Z3 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Skp2Q9Z0Z3 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Skp2Q9Z0Z3 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Skp2Q9Z0Z3 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Skp2Q9Z0Z3 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Skp2Q9Z0Z3 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Skp2Q9Z0Z3 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Skp2Q9Z0Z3 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Skp2Q9Z0Z3 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Skp2Q9Z0Z3 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Skp2Q9Z0Z3 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Skp2Q9Z0Z3 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Skp2Q9Z0Z3 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Skp2Q9Z0Z3 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Skp2Q9Z0Z3 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Skp2Q9Z0Z3 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Skp2Q9Z0Z3 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Skp2Q9Z0Z3 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Skp2Q9Z0Z3 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Skp2Q9Z0Z3 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Skp2Q9Z0Z3 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Skp2Q9Z0Z3 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Skp2Q9Z0Z3 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Skp2Q9Z0Z3 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Skp2Q9Z0Z3 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Skp2Q9Z0Z3 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Skp2Q9Z0Z3 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Skp2Q9Z0Z3 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Skp2Q9Z0Z3 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Skp2Q9Z0Z3 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Skp2Q9Z0Z3 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Skp2Q9Z0Z3 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Skp2Q9Z0Z3 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Skp2Q9Z0Z3 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Skp2Q9Z0Z3 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Skp2Q9Z0Z3 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Skp2Q9Z0Z3 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Skp2Q9Z0Z3 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Skp2Q9Z0Z3 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Skp2Q9Z0Z3 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Skp2Q9Z0Z3 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Skp2Q9Z0Z3 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Skp2Q9Z0Z3 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Skp2Q9Z0Z3 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Skp2Q9Z0Z3 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Skp2Q9Z0Z3 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Skp2Q9Z0Z3 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Skp2Q9Z0Z3 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Skp2Q9Z0Z3 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Skp2Q9Z0Z3 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Skp2Q9Z0Z3 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Skp2Q9Z0Z3 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Skp2Q9Z0Z3 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Skp2Q9Z0Z3 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms