Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU28

Pfdn5, Prefoldin subunit 5, mousemouse

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Length 154 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn5Q9WU28 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 Vrtn-203ENSMUST00000167227 3440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 Exo1-201ENSMUST00000039725 7796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 Clip1-202ENSMUST00000063905 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 Eya1-209ENSMUST00000190337 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 Egfr-201ENSMUST00000020329 10208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 Zmynd8-205ENSMUST00000109266 5072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 Zmynd8-221ENSMUST00000177633 5093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 Abl2-202ENSMUST00000166172 10151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Pfdn5Q9WU28 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Pfdn5Q9WU28 Mid1-214ENSMUST00000163810 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
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Pfdn5Q9WU28 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Pfdn5Q9WU28 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Pfdn5Q9WU28 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Pfdn5Q9WU28 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Pfdn5Q9WU28 Spg20-203ENSMUST00000117341 2957 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Pfdn5Q9WU28 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 Cacna1c-226ENSMUST00000219833 7591 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 Kif4-201ENSMUST00000048962 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 Icam1-201ENSMUST00000086399 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 Vmn1r184-207ENSMUST00000228369 6361 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 Rab3gap2-201ENSMUST00000069652 7052 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 Cln8-201ENSMUST00000027554 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 Atg2a-201ENSMUST00000045351 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 Hivep2-204ENSMUST00000187083 9268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Pfdn5Q9WU28 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
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