Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1C0

Taf7, Transcription initiation factor TFIID subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf7Q9R1C0 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Taf7Q9R1C0 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Taf7Q9R1C0 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Taf7Q9R1C0 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Taf7Q9R1C0 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Taf7Q9R1C0 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Taf7Q9R1C0 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Taf7Q9R1C0 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf7Q9R1C0 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf7Q9R1C0 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf7Q9R1C0 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf7Q9R1C0 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf7Q9R1C0 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf7Q9R1C0 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf7Q9R1C0 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf7Q9R1C0 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf7Q9R1C0 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf7Q9R1C0 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf7Q9R1C0 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf7Q9R1C0 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf7Q9R1C0 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf7Q9R1C0 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf7Q9R1C0 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf7Q9R1C0 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf7Q9R1C0 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf7Q9R1C0 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf7Q9R1C0 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf7Q9R1C0 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf7Q9R1C0 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf7Q9R1C0 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf7Q9R1C0 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf7Q9R1C0 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf7Q9R1C0 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf7Q9R1C0 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf7Q9R1C0 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf7Q9R1C0 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf7Q9R1C0 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf7Q9R1C0 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf7Q9R1C0 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf7Q9R1C0 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf7Q9R1C0 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf7Q9R1C0 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf7Q9R1C0 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf7Q9R1C0 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf7Q9R1C0 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf7Q9R1C0 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf7Q9R1C0 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf7Q9R1C0 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf7Q9R1C0 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf7Q9R1C0 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf7Q9R1C0 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf7Q9R1C0 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf7Q9R1C0 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf7Q9R1C0 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf7Q9R1C0 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf7Q9R1C0 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf7Q9R1C0 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf7Q9R1C0 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf7Q9R1C0 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf7Q9R1C0 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf7Q9R1C0 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf7Q9R1C0 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf7Q9R1C0 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf7Q9R1C0 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf7Q9R1C0 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf7Q9R1C0 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf7Q9R1C0 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf7Q9R1C0 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf7Q9R1C0 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf7Q9R1C0 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf7Q9R1C0 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf7Q9R1C0 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf7Q9R1C0 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf7Q9R1C0 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf7Q9R1C0 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf7Q9R1C0 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf7Q9R1C0 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf7Q9R1C0 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf7Q9R1C0 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf7Q9R1C0 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf7Q9R1C0 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf7Q9R1C0 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf7Q9R1C0 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf7Q9R1C0 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf7Q9R1C0 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf7Q9R1C0 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf7Q9R1C0 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf7Q9R1C0 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf7Q9R1C0 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf7Q9R1C0 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf7Q9R1C0 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf7Q9R1C0 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf7Q9R1C0 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf7Q9R1C0 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf7Q9R1C0 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf7Q9R1C0 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf7Q9R1C0 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf7Q9R1C0 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf7Q9R1C0 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf7Q9R1C0 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms