Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD4

Ercc4, DNA repair endonuclease XPF, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc4Q9QZD4 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ercc4Q9QZD4 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ercc4Q9QZD4 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ercc4Q9QZD4 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ercc4Q9QZD4 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ercc4Q9QZD4 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ercc4Q9QZD4 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ercc4Q9QZD4 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Ercc4Q9QZD4 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ercc4Q9QZD4 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ercc4Q9QZD4 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ercc4Q9QZD4 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ercc4Q9QZD4 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ercc4Q9QZD4 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ercc4Q9QZD4 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ercc4Q9QZD4 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ercc4Q9QZD4 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Ercc4Q9QZD4 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ercc4Q9QZD4 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ercc4Q9QZD4 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ercc4Q9QZD4 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Ercc4Q9QZD4 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ercc4Q9QZD4 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Ercc4Q9QZD4 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ercc4Q9QZD4 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ercc4Q9QZD4 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ercc4Q9QZD4 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ercc4Q9QZD4 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ercc4Q9QZD4 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ercc4Q9QZD4 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ercc4Q9QZD4 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ercc4Q9QZD4 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ercc4Q9QZD4 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ercc4Q9QZD4 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ercc4Q9QZD4 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ercc4Q9QZD4 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ercc4Q9QZD4 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ercc4Q9QZD4 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Ercc4Q9QZD4 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ercc4Q9QZD4 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Ercc4Q9QZD4 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ercc4Q9QZD4 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ercc4Q9QZD4 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ercc4Q9QZD4 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ercc4Q9QZD4 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ercc4Q9QZD4 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ercc4Q9QZD4 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ercc4Q9QZD4 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Ercc4Q9QZD4 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ercc4Q9QZD4 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
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Ercc4Q9QZD4 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ercc4Q9QZD4 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ercc4Q9QZD4 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ercc4Q9QZD4 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Ercc4Q9QZD4 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ercc4Q9QZD4 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ercc4Q9QZD4 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
Ercc4Q9QZD4 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ercc4Q9QZD4 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
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Ercc4Q9QZD4 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ercc4Q9QZD4 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ercc4Q9QZD4 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
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