Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY53

Nphp1, Nephrocystin-1, mousemouse

Predictions only

Length 687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp1Q9QY53 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nphp1Q9QY53 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nphp1Q9QY53 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nphp1Q9QY53 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nphp1Q9QY53 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nphp1Q9QY53 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Nphp1Q9QY53 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nphp1Q9QY53 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nphp1Q9QY53 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nphp1Q9QY53 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nphp1Q9QY53 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nphp1Q9QY53 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nphp1Q9QY53 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Nphp1Q9QY53 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Nphp1Q9QY53 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nphp1Q9QY53 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nphp1Q9QY53 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nphp1Q9QY53 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Nphp1Q9QY53 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Nphp1Q9QY53 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nphp1Q9QY53 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nphp1Q9QY53 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nphp1Q9QY53 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nphp1Q9QY53 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nphp1Q9QY53 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nphp1Q9QY53 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nphp1Q9QY53 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nphp1Q9QY53 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nphp1Q9QY53 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nphp1Q9QY53 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nphp1Q9QY53 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nphp1Q9QY53 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nphp1Q9QY53 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nphp1Q9QY53 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nphp1Q9QY53 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nphp1Q9QY53 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nphp1Q9QY53 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nphp1Q9QY53 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Nphp1Q9QY53 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nphp1Q9QY53 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nphp1Q9QY53 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nphp1Q9QY53 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nphp1Q9QY53 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nphp1Q9QY53 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nphp1Q9QY53 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nphp1Q9QY53 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nphp1Q9QY53 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nphp1Q9QY53 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nphp1Q9QY53 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nphp1Q9QY53 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nphp1Q9QY53 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nphp1Q9QY53 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nphp1Q9QY53 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nphp1Q9QY53 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Nphp1Q9QY53 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Nphp1Q9QY53 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nphp1Q9QY53 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nphp1Q9QY53 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nphp1Q9QY53 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nphp1Q9QY53 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nphp1Q9QY53 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nphp1Q9QY53 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nphp1Q9QY53 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nphp1Q9QY53 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nphp1Q9QY53 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nphp1Q9QY53 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nphp1Q9QY53 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Nphp1Q9QY53 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nphp1Q9QY53 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nphp1Q9QY53 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nphp1Q9QY53 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nphp1Q9QY53 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nphp1Q9QY53 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Nphp1Q9QY53 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Nphp1Q9QY53 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nphp1Q9QY53 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nphp1Q9QY53 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Nphp1Q9QY53 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nphp1Q9QY53 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Nphp1Q9QY53 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Nphp1Q9QY53 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nphp1Q9QY53 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nphp1Q9QY53 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nphp1Q9QY53 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nphp1Q9QY53 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nphp1Q9QY53 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nphp1Q9QY53 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nphp1Q9QY53 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nphp1Q9QY53 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nphp1Q9QY53 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nphp1Q9QY53 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nphp1Q9QY53 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nphp1Q9QY53 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nphp1Q9QY53 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nphp1Q9QY53 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nphp1Q9QY53 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nphp1Q9QY53 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nphp1Q9QY53 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nphp1Q9QY53 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nphp1Q9QY53 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 125.1 ms