Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

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Length 665 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
ChmQ9QXG2 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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