Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME7

Trappc2l, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2lQ9JME7 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 Esco1-201ENSMUST00000025142 4433 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 Vcan-202ENSMUST00000109544 5702 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 Col20a1-201ENSMUST00000108856 4489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 Nhsl1-201ENSMUST00000037341 7321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 Slc7a1-201ENSMUST00000048116 7179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 Dclk1-204ENSMUST00000196745 7962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 Bod1l-201ENSMUST00000050556 10540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 Kdm4a-204ENSMUST00000106406 4663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 Madd-204ENSMUST00000077941 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 Madd-205ENSMUST00000099723 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 Col5a2-201ENSMUST00000086430 6625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Trappc2lQ9JME7 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms