Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLR9

Higd1a, HIG1 domain family member 1A, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1aQ9JLR9 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Higd1aQ9JLR9 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Higd1aQ9JLR9 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Higd1aQ9JLR9 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Higd1aQ9JLR9 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Higd1aQ9JLR9 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Higd1aQ9JLR9 Ptprg-201ENSMUST00000022264 9213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Higd1aQ9JLR9 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Higd1aQ9JLR9 Pcdh18-201ENSMUST00000035931 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Higd1aQ9JLR9 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Higd1aQ9JLR9 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Higd1aQ9JLR9 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Higd1aQ9JLR9 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Higd1aQ9JLR9 Col11a1-201ENSMUST00000092155 7667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Higd1aQ9JLR9 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Higd1aQ9JLR9 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Higd1aQ9JLR9 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Higd1aQ9JLR9 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Higd1aQ9JLR9 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Higd1aQ9JLR9 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Higd1aQ9JLR9 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Higd1aQ9JLR9 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Higd1aQ9JLR9 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Higd1aQ9JLR9 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Higd1aQ9JLR9 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Higd1aQ9JLR9 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Higd1aQ9JLR9 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
Higd1aQ9JLR9 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Higd1aQ9JLR9 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Higd1aQ9JLR9 Bicd2-202ENSMUST00000110084 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Higd1aQ9JLR9 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Higd1aQ9JLR9 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Higd1aQ9JLR9 Ankrd52-201ENSMUST00000014642 6620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Higd1aQ9JLR9 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Higd1aQ9JLR9 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Higd1aQ9JLR9 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Higd1aQ9JLR9 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Higd1aQ9JLR9 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Higd1aQ9JLR9 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Higd1aQ9JLR9 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Higd1aQ9JLR9 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
Higd1aQ9JLR9 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
Higd1aQ9JLR9 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Higd1aQ9JLR9 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Higd1aQ9JLR9 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Higd1aQ9JLR9 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Higd1aQ9JLR9 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Higd1aQ9JLR9 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Higd1aQ9JLR9 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Higd1aQ9JLR9 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Higd1aQ9JLR9 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Higd1aQ9JLR9 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Higd1aQ9JLR9 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
Higd1aQ9JLR9 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Higd1aQ9JLR9 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Higd1aQ9JLR9 Col5a2-201ENSMUST00000086430 6625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Higd1aQ9JLR9 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Higd1aQ9JLR9 Fibcd1-201ENSMUST00000028188 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Higd1aQ9JLR9 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Higd1aQ9JLR9 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Higd1aQ9JLR9 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Higd1aQ9JLR9 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Higd1aQ9JLR9 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Higd1aQ9JLR9 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Higd1aQ9JLR9 Bcl9l-203ENSMUST00000218183 6771 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Higd1aQ9JLR9 Tacr1-201ENSMUST00000032122 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Higd1aQ9JLR9 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Higd1aQ9JLR9 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Higd1aQ9JLR9 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Higd1aQ9JLR9 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Higd1aQ9JLR9 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Higd1aQ9JLR9 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Higd1aQ9JLR9 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Higd1aQ9JLR9 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Higd1aQ9JLR9 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Higd1aQ9JLR9 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Higd1aQ9JLR9 Cabin1-201ENSMUST00000001712 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Higd1aQ9JLR9 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Higd1aQ9JLR9 Spata31d1a-203ENSMUST00000224982 5325 ntAPPRIS P1 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Higd1aQ9JLR9 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Higd1aQ9JLR9 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Higd1aQ9JLR9 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Higd1aQ9JLR9 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Higd1aQ9JLR9 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Higd1aQ9JLR9 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Higd1aQ9JLR9 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Higd1aQ9JLR9 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Higd1aQ9JLR9 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Higd1aQ9JLR9 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Higd1aQ9JLR9 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Higd1aQ9JLR9 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Higd1aQ9JLR9 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Higd1aQ9JLR9 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Higd1aQ9JLR9 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Higd1aQ9JLR9 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Higd1aQ9JLR9 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Higd1aQ9JLR9 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Higd1aQ9JLR9 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Higd1aQ9JLR9 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Higd1aQ9JLR9 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.2 ms