Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKE2

Trem1, Triggering receptor expressed on myeloid cells 1, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem1Q9JKE2 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Trem1Q9JKE2 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Trem1Q9JKE2 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Trem1Q9JKE2 Tnip1-203ENSMUST00000102731 2973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Trem1Q9JKE2 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Trem1Q9JKE2 Glb1l2-207ENSMUST00000162702 2555 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Trem1Q9JKE2 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Trem1Q9JKE2 Gm28581-201ENSMUST00000186086 2177 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Trem1Q9JKE2 Rasgef1a-203ENSMUST00000203804 2183 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Trem1Q9JKE2 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Trem1Q9JKE2 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Trem1Q9JKE2 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Trem1Q9JKE2 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Trem1Q9JKE2 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Trem1Q9JKE2 Fan1-201ENSMUST00000163289 3460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Trem1Q9JKE2 Cd19-201ENSMUST00000032968 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Trem1Q9JKE2 Capn8-201ENSMUST00000048941 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Trem1Q9JKE2 Timd2-202ENSMUST00000109225 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Trem1Q9JKE2 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Trem1Q9JKE2 Txnrd1-201ENSMUST00000020484 3325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Trem1Q9JKE2 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Trem1Q9JKE2 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Trem1Q9JKE2 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Trem1Q9JKE2 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Trem1Q9JKE2 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Trem1Q9JKE2 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Trem1Q9JKE2 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Trem1Q9JKE2 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Trem1Q9JKE2 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Trem1Q9JKE2 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Trem1Q9JKE2 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Trem1Q9JKE2 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Trem1Q9JKE2 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Trem1Q9JKE2 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Trem1Q9JKE2 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Trem1Q9JKE2 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Trem1Q9JKE2 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Trem1Q9JKE2 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Trem1Q9JKE2 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Trem1Q9JKE2 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Trem1Q9JKE2 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Trem1Q9JKE2 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Trem1Q9JKE2 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Trem1Q9JKE2 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Trem1Q9JKE2 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Trem1Q9JKE2 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Trem1Q9JKE2 Cdk5rap1-201ENSMUST00000028990 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Trem1Q9JKE2 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Trem1Q9JKE2 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Trem1Q9JKE2 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Trem1Q9JKE2 Msh3-201ENSMUST00000022220 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Trem1Q9JKE2 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Trem1Q9JKE2 Armcx6-201ENSMUST00000052431 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Trem1Q9JKE2 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Trem1Q9JKE2 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Trem1Q9JKE2 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Trem1Q9JKE2 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Trem1Q9JKE2 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Trem1Q9JKE2 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Trem1Q9JKE2 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Trem1Q9JKE2 Bsdc1-201ENSMUST00000048162 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Trem1Q9JKE2 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Trem1Q9JKE2 Slitrk3-202ENSMUST00000192477 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Trem1Q9JKE2 Ocstamp-201ENSMUST00000029213 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Trem1Q9JKE2 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Trem1Q9JKE2 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Trem1Q9JKE2 Gm37057-201ENSMUST00000192624 1916 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Trem1Q9JKE2 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Trem1Q9JKE2 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Trem1Q9JKE2 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Trem1Q9JKE2 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Trem1Q9JKE2 Zfp354b-201ENSMUST00000109124 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Trem1Q9JKE2 Sap18-204ENSMUST00000128764 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Trem1Q9JKE2 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Trem1Q9JKE2 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Trem1Q9JKE2 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Trem1Q9JKE2 Il10ra-202ENSMUST00000176222 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Trem1Q9JKE2 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Trem1Q9JKE2 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Trem1Q9JKE2 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Trem1Q9JKE2 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Trem1Q9JKE2 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Trem1Q9JKE2 Mkks-202ENSMUST00000110089 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Trem1Q9JKE2 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Trem1Q9JKE2 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Trem1Q9JKE2 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Trem1Q9JKE2 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Trem1Q9JKE2 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Trem1Q9JKE2 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Trem1Q9JKE2 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Trem1Q9JKE2 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Trem1Q9JKE2 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Trem1Q9JKE2 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Trem1Q9JKE2 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Trem1Q9JKE2 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Trem1Q9JKE2 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Trem1Q9JKE2 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Trem1Q9JKE2 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Trem1Q9JKE2 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Trem1Q9JKE2 Olfr464-205ENSMUST00000217112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms