Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN2

Trim39, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM39, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim39Q9ESN2 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trim39Q9ESN2 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trim39Q9ESN2 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trim39Q9ESN2 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trim39Q9ESN2 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trim39Q9ESN2 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trim39Q9ESN2 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trim39Q9ESN2 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Trim39Q9ESN2 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trim39Q9ESN2 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trim39Q9ESN2 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trim39Q9ESN2 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trim39Q9ESN2 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trim39Q9ESN2 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trim39Q9ESN2 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trim39Q9ESN2 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trim39Q9ESN2 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trim39Q9ESN2 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trim39Q9ESN2 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trim39Q9ESN2 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trim39Q9ESN2 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trim39Q9ESN2 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trim39Q9ESN2 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trim39Q9ESN2 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trim39Q9ESN2 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trim39Q9ESN2 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trim39Q9ESN2 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trim39Q9ESN2 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Trim39Q9ESN2 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trim39Q9ESN2 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trim39Q9ESN2 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trim39Q9ESN2 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Trim39Q9ESN2 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trim39Q9ESN2 Gm28745-201ENSMUST00000190069 305 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Trim39Q9ESN2 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Trim39Q9ESN2 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Trim39Q9ESN2 Gm45359-201ENSMUST00000210635 427 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Trim39Q9ESN2 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Trim39Q9ESN2 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trim39Q9ESN2 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trim39Q9ESN2 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trim39Q9ESN2 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trim39Q9ESN2 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trim39Q9ESN2 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trim39Q9ESN2 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trim39Q9ESN2 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trim39Q9ESN2 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trim39Q9ESN2 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trim39Q9ESN2 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trim39Q9ESN2 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trim39Q9ESN2 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trim39Q9ESN2 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trim39Q9ESN2 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trim39Q9ESN2 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trim39Q9ESN2 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trim39Q9ESN2 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trim39Q9ESN2 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trim39Q9ESN2 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Trim39Q9ESN2 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trim39Q9ESN2 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trim39Q9ESN2 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trim39Q9ESN2 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trim39Q9ESN2 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trim39Q9ESN2 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trim39Q9ESN2 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trim39Q9ESN2 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trim39Q9ESN2 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Trim39Q9ESN2 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trim39Q9ESN2 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trim39Q9ESN2 C130071C03Rik-203ENSMUST00000182788 1368 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trim39Q9ESN2 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trim39Q9ESN2 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Trim39Q9ESN2 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trim39Q9ESN2 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trim39Q9ESN2 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trim39Q9ESN2 Sox5it-201ENSMUST00000144026 1207 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trim39Q9ESN2 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trim39Q9ESN2 Gm15063-201ENSMUST00000152648 895 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trim39Q9ESN2 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trim39Q9ESN2 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trim39Q9ESN2 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Trim39Q9ESN2 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trim39Q9ESN2 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trim39Q9ESN2 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trim39Q9ESN2 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trim39Q9ESN2 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Trim39Q9ESN2 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Trim39Q9ESN2 9530097N15Rik-201ENSMUST00000197819 1068 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Trim39Q9ESN2 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Trim39Q9ESN2 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trim39Q9ESN2 Olfr1248-201ENSMUST00000216129 1078 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trim39Q9ESN2 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trim39Q9ESN2 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trim39Q9ESN2 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Trim39Q9ESN2 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trim39Q9ESN2 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Trim39Q9ESN2 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms