Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp29Q9ES63 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp29Q9ES63 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp29Q9ES63 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp29Q9ES63 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp29Q9ES63 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp29Q9ES63 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp29Q9ES63 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp29Q9ES63 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
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Usp29Q9ES63 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp29Q9ES63 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp29Q9ES63 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Usp29Q9ES63 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Usp29Q9ES63 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Usp29Q9ES63 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Usp29Q9ES63 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Usp29Q9ES63 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Usp29Q9ES63 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Usp29Q9ES63 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Usp29Q9ES63 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
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Usp29Q9ES63 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Usp29Q9ES63 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
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Usp29Q9ES63 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Usp29Q9ES63 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp29Q9ES63 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp29Q9ES63 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp29Q9ES63 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Usp29Q9ES63 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp29Q9ES63 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Usp29Q9ES63 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp29Q9ES63 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Usp29Q9ES63 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Usp29Q9ES63 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp29Q9ES63 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Usp29Q9ES63 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp29Q9ES63 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Usp29Q9ES63 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp29Q9ES63 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp29Q9ES63 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp29Q9ES63 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp29Q9ES63 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp29Q9ES63 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp29Q9ES63 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Usp29Q9ES63 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp29Q9ES63 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Usp29Q9ES63 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp29Q9ES63 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp29Q9ES63 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Usp29Q9ES63 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Usp29Q9ES63 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp29Q9ES63 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp29Q9ES63 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp29Q9ES63 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Usp29Q9ES63 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp29Q9ES63 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp29Q9ES63 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp29Q9ES63 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp29Q9ES63 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp29Q9ES63 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
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