Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG7

Srpra, Signal recognition particle receptor subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpraQ9DBG7 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
SrpraQ9DBG7 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms