Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Smg9Q9DB90 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Smg9Q9DB90 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Smg9Q9DB90 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Smg9Q9DB90 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Smg9Q9DB90 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Smg9Q9DB90 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Smg9Q9DB90 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Smg9Q9DB90 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Smg9Q9DB90 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Smg9Q9DB90 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Smg9Q9DB90 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Smg9Q9DB90 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Smg9Q9DB90 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Smg9Q9DB90 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Smg9Q9DB90 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Smg9Q9DB90 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Smg9Q9DB90 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Smg9Q9DB90 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Smg9Q9DB90 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Smg9Q9DB90 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Smg9Q9DB90 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Smg9Q9DB90 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Smg9Q9DB90 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Smg9Q9DB90 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Smg9Q9DB90 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Smg9Q9DB90 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Smg9Q9DB90 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Smg9Q9DB90 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Smg9Q9DB90 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Smg9Q9DB90 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Smg9Q9DB90 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Smg9Q9DB90 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Smg9Q9DB90 Olfr812-202ENSMUST00000203571 1232 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Smg9Q9DB90 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Smg9Q9DB90 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
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Smg9Q9DB90 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
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Smg9Q9DB90 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Smg9Q9DB90 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Smg9Q9DB90 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Smg9Q9DB90 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Smg9Q9DB90 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
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Smg9Q9DB90 Gm26540-201ENSMUST00000181858 1310 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Smg9Q9DB90 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Smg9Q9DB90 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
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Smg9Q9DB90 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Smg9Q9DB90 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Smg9Q9DB90 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Smg9Q9DB90 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Smg9Q9DB90 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Smg9Q9DB90 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Smg9Q9DB90 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Smg9Q9DB90 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Smg9Q9DB90 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Smg9Q9DB90 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Smg9Q9DB90 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Smg9Q9DB90 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smg9Q9DB90 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smg9Q9DB90 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Smg9Q9DB90 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smg9Q9DB90 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smg9Q9DB90 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smg9Q9DB90 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smg9Q9DB90 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smg9Q9DB90 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smg9Q9DB90 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smg9Q9DB90 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smg9Q9DB90 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smg9Q9DB90 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smg9Q9DB90 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smg9Q9DB90 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smg9Q9DB90 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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