Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAL0

Smim23, Small integral membrane protein 23, mousemouse

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Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim23Q9DAL0 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Smim23Q9DAL0 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Smim23Q9DAL0 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Smim23Q9DAL0 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Smim23Q9DAL0 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Smim23Q9DAL0 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Smim23Q9DAL0 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Smim23Q9DAL0 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Smim23Q9DAL0 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Smim23Q9DAL0 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Smim23Q9DAL0 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Smim23Q9DAL0 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Smim23Q9DAL0 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Smim23Q9DAL0 Dclk3-201ENSMUST00000111879 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Smim23Q9DAL0 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Smim23Q9DAL0 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.63
Smim23Q9DAL0 Gm43221-201ENSMUST00000197612 2071 ntBASIC11.08□□□□□ -0.63
Smim23Q9DAL0 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.63
Smim23Q9DAL0 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Smim23Q9DAL0 Ppp1r17-201ENSMUST00000052827 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Smim23Q9DAL0 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Smim23Q9DAL0 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Smim23Q9DAL0 Mdh1-201ENSMUST00000102874 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Smim23Q9DAL0 Il27ra-201ENSMUST00000005601 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Smim23Q9DAL0 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Smim23Q9DAL0 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Smim23Q9DAL0 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Smim23Q9DAL0 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Smim23Q9DAL0 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Smim23Q9DAL0 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Smim23Q9DAL0 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Smim23Q9DAL0 Gm13694-201ENSMUST00000178533 2493 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Smim23Q9DAL0 Gm13693-201ENSMUST00000178960 2493 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Smim23Q9DAL0 Gm13698-202ENSMUST00000179192 2493 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Smim23Q9DAL0 Gm13696-202ENSMUST00000180347 2493 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Smim23Q9DAL0 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Smim23Q9DAL0 Gm13691-201ENSMUST00000099947 2493 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Smim23Q9DAL0 Gm13697-201ENSMUST00000099948 2493 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Smim23Q9DAL0 Gm13695-201ENSMUST00000099951 2493 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Smim23Q9DAL0 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Smim23Q9DAL0 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Smim23Q9DAL0 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Smim23Q9DAL0 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Smim23Q9DAL0 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Smim23Q9DAL0 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Smim23Q9DAL0 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Smim23Q9DAL0 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Smim23Q9DAL0 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Smim23Q9DAL0 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Smim23Q9DAL0 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Smim23Q9DAL0 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Smim23Q9DAL0 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Smim23Q9DAL0 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Smim23Q9DAL0 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Smim23Q9DAL0 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Smim23Q9DAL0 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Smim23Q9DAL0 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Smim23Q9DAL0 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Smim23Q9DAL0 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Smim23Q9DAL0 Brat1-202ENSMUST00000100505 3431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Smim23Q9DAL0 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Smim23Q9DAL0 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Smim23Q9DAL0 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Smim23Q9DAL0 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Smim23Q9DAL0 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Smim23Q9DAL0 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Smim23Q9DAL0 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Smim23Q9DAL0 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Smim23Q9DAL0 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Smim23Q9DAL0 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Smim23Q9DAL0 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Smim23Q9DAL0 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Smim23Q9DAL0 Mpl-202ENSMUST00000102671 2934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Smim23Q9DAL0 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Smim23Q9DAL0 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Smim23Q9DAL0 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Smim23Q9DAL0 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Smim23Q9DAL0 Nxpe5-204ENSMUST00000161047 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Smim23Q9DAL0 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Smim23Q9DAL0 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Smim23Q9DAL0 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Smim23Q9DAL0 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Smim23Q9DAL0 Tubb2b-201ENSMUST00000075774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Smim23Q9DAL0 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Smim23Q9DAL0 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Smim23Q9DAL0 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Smim23Q9DAL0 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Smim23Q9DAL0 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Smim23Q9DAL0 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Smim23Q9DAL0 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Smim23Q9DAL0 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Smim23Q9DAL0 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Smim23Q9DAL0 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Smim23Q9DAL0 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Smim23Q9DAL0 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Smim23Q9DAL0 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Smim23Q9DAL0 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Smim23Q9DAL0 Nfic-201ENSMUST00000020461 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Smim23Q9DAL0 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Smim23Q9DAL0 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms