Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9R0

Rnf125, E3 ubiquitin-protein ligase RNF125, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf125Q9D9R0 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnf125Q9D9R0 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnf125Q9D9R0 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnf125Q9D9R0 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnf125Q9D9R0 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnf125Q9D9R0 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnf125Q9D9R0 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnf125Q9D9R0 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnf125Q9D9R0 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnf125Q9D9R0 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnf125Q9D9R0 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnf125Q9D9R0 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnf125Q9D9R0 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnf125Q9D9R0 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnf125Q9D9R0 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnf125Q9D9R0 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnf125Q9D9R0 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnf125Q9D9R0 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnf125Q9D9R0 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnf125Q9D9R0 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnf125Q9D9R0 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnf125Q9D9R0 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnf125Q9D9R0 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnf125Q9D9R0 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnf125Q9D9R0 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnf125Q9D9R0 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnf125Q9D9R0 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnf125Q9D9R0 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rnf125Q9D9R0 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rnf125Q9D9R0 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rnf125Q9D9R0 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rnf125Q9D9R0 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rnf125Q9D9R0 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf125Q9D9R0 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf125Q9D9R0 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf125Q9D9R0 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf125Q9D9R0 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf125Q9D9R0 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf125Q9D9R0 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf125Q9D9R0 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf125Q9D9R0 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf125Q9D9R0 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf125Q9D9R0 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf125Q9D9R0 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf125Q9D9R0 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf125Q9D9R0 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf125Q9D9R0 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf125Q9D9R0 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf125Q9D9R0 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf125Q9D9R0 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf125Q9D9R0 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf125Q9D9R0 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf125Q9D9R0 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf125Q9D9R0 Gm20052-201ENSMUST00000200831 1525 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf125Q9D9R0 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf125Q9D9R0 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf125Q9D9R0 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf125Q9D9R0 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf125Q9D9R0 Gm16140-201ENSMUST00000117191 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf125Q9D9R0 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf125Q9D9R0 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf125Q9D9R0 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf125Q9D9R0 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf125Q9D9R0 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf125Q9D9R0 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf125Q9D9R0 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf125Q9D9R0 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf125Q9D9R0 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf125Q9D9R0 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf125Q9D9R0 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf125Q9D9R0 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf125Q9D9R0 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf125Q9D9R0 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf125Q9D9R0 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf125Q9D9R0 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf125Q9D9R0 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf125Q9D9R0 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf125Q9D9R0 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf125Q9D9R0 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf125Q9D9R0 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf125Q9D9R0 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf125Q9D9R0 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf125Q9D9R0 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf125Q9D9R0 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf125Q9D9R0 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf125Q9D9R0 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf125Q9D9R0 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf125Q9D9R0 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf125Q9D9R0 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf125Q9D9R0 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf125Q9D9R0 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf125Q9D9R0 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf125Q9D9R0 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf125Q9D9R0 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf125Q9D9R0 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf125Q9D9R0 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rnf125Q9D9R0 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf125Q9D9R0 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf125Q9D9R0 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf125Q9D9R0 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms