Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P7

Gtf3c6, General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6Q9D8P7 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Dclk1-213ENSMUST00000199702 2922 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Gtf3c6Q9D8P7 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Gm19324-201ENSMUST00000213229 1169 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Gabarapl2-201ENSMUST00000034428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
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Gtf3c6Q9D8P7 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
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Gtf3c6Q9D8P7 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Zfp36-201ENSMUST00000051241 2790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gtf3c6Q9D8P7 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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