Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cldn22Q9D7U6 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cldn22Q9D7U6 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Cldn22Q9D7U6 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cldn22Q9D7U6 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cldn22Q9D7U6 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cldn22Q9D7U6 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cldn22Q9D7U6 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cldn22Q9D7U6 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cldn22Q9D7U6 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Cldn22Q9D7U6 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cldn22Q9D7U6 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cldn22Q9D7U6 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cldn22Q9D7U6 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cldn22Q9D7U6 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cldn22Q9D7U6 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Cldn22Q9D7U6 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Cldn22Q9D7U6 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cldn22Q9D7U6 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cldn22Q9D7U6 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cldn22Q9D7U6 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Cldn22Q9D7U6 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cldn22Q9D7U6 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cldn22Q9D7U6 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Cldn22Q9D7U6 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cldn22Q9D7U6 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cldn22Q9D7U6 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cldn22Q9D7U6 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cldn22Q9D7U6 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cldn22Q9D7U6 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cldn22Q9D7U6 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cldn22Q9D7U6 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cldn22Q9D7U6 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cldn22Q9D7U6 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cldn22Q9D7U6 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cldn22Q9D7U6 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cldn22Q9D7U6 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cldn22Q9D7U6 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cldn22Q9D7U6 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cldn22Q9D7U6 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Cldn22Q9D7U6 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn22Q9D7U6 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn22Q9D7U6 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn22Q9D7U6 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn22Q9D7U6 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn22Q9D7U6 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn22Q9D7U6 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn22Q9D7U6 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn22Q9D7U6 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn22Q9D7U6 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn22Q9D7U6 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn22Q9D7U6 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn22Q9D7U6 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn22Q9D7U6 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn22Q9D7U6 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn22Q9D7U6 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn22Q9D7U6 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn22Q9D7U6 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn22Q9D7U6 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn22Q9D7U6 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn22Q9D7U6 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn22Q9D7U6 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn22Q9D7U6 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn22Q9D7U6 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn22Q9D7U6 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn22Q9D7U6 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn22Q9D7U6 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn22Q9D7U6 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn22Q9D7U6 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn22Q9D7U6 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn22Q9D7U6 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn22Q9D7U6 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn22Q9D7U6 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn22Q9D7U6 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn22Q9D7U6 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn22Q9D7U6 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn22Q9D7U6 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn22Q9D7U6 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn22Q9D7U6 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cldn22Q9D7U6 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Cldn22Q9D7U6 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Cldn22Q9D7U6 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Cldn22Q9D7U6 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn22Q9D7U6 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn22Q9D7U6 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn22Q9D7U6 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn22Q9D7U6 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn22Q9D7U6 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn22Q9D7U6 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn22Q9D7U6 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn22Q9D7U6 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn22Q9D7U6 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn22Q9D7U6 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn22Q9D7U6 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn22Q9D7U6 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn22Q9D7U6 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn22Q9D7U6 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn22Q9D7U6 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn22Q9D7U6 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn22Q9D7U6 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
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