Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7T1

Rep15, Rab15 effector protein, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rep15Q9D7T1 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rep15Q9D7T1 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rep15Q9D7T1 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rep15Q9D7T1 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rep15Q9D7T1 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rep15Q9D7T1 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Rep15Q9D7T1 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rep15Q9D7T1 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rep15Q9D7T1 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rep15Q9D7T1 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rep15Q9D7T1 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rep15Q9D7T1 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rep15Q9D7T1 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Rep15Q9D7T1 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rep15Q9D7T1 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rep15Q9D7T1 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rep15Q9D7T1 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rep15Q9D7T1 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rep15Q9D7T1 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rep15Q9D7T1 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rep15Q9D7T1 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rep15Q9D7T1 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rep15Q9D7T1 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rep15Q9D7T1 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rep15Q9D7T1 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rep15Q9D7T1 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rep15Q9D7T1 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rep15Q9D7T1 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rep15Q9D7T1 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rep15Q9D7T1 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rep15Q9D7T1 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rep15Q9D7T1 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rep15Q9D7T1 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rep15Q9D7T1 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rep15Q9D7T1 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rep15Q9D7T1 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rep15Q9D7T1 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rep15Q9D7T1 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rep15Q9D7T1 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rep15Q9D7T1 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rep15Q9D7T1 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rep15Q9D7T1 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rep15Q9D7T1 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rep15Q9D7T1 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rep15Q9D7T1 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rep15Q9D7T1 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rep15Q9D7T1 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rep15Q9D7T1 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rep15Q9D7T1 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rep15Q9D7T1 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rep15Q9D7T1 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rep15Q9D7T1 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rep15Q9D7T1 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rep15Q9D7T1 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rep15Q9D7T1 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Rep15Q9D7T1 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rep15Q9D7T1 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rep15Q9D7T1 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rep15Q9D7T1 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rep15Q9D7T1 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rep15Q9D7T1 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rep15Q9D7T1 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rep15Q9D7T1 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rep15Q9D7T1 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Rep15Q9D7T1 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Rep15Q9D7T1 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rep15Q9D7T1 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rep15Q9D7T1 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rep15Q9D7T1 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rep15Q9D7T1 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rep15Q9D7T1 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rep15Q9D7T1 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rep15Q9D7T1 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rep15Q9D7T1 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rep15Q9D7T1 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rep15Q9D7T1 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rep15Q9D7T1 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rep15Q9D7T1 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rep15Q9D7T1 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Rep15Q9D7T1 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rep15Q9D7T1 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rep15Q9D7T1 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rep15Q9D7T1 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rep15Q9D7T1 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rep15Q9D7T1 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rep15Q9D7T1 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Rep15Q9D7T1 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rep15Q9D7T1 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rep15Q9D7T1 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rep15Q9D7T1 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rep15Q9D7T1 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rep15Q9D7T1 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rep15Q9D7T1 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rep15Q9D7T1 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rep15Q9D7T1 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rep15Q9D7T1 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rep15Q9D7T1 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rep15Q9D7T1 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rep15Q9D7T1 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rep15Q9D7T1 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms