Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y7

Msra, Mitochondrial peptide methionine sulfoxide reductase, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsraQ9D6Y7 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MsraQ9D6Y7 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MsraQ9D6Y7 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MsraQ9D6Y7 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
MsraQ9D6Y7 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MsraQ9D6Y7 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MsraQ9D6Y7 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MsraQ9D6Y7 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MsraQ9D6Y7 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MsraQ9D6Y7 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
MsraQ9D6Y7 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
MsraQ9D6Y7 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MsraQ9D6Y7 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MsraQ9D6Y7 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
MsraQ9D6Y7 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
MsraQ9D6Y7 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
MsraQ9D6Y7 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
MsraQ9D6Y7 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
MsraQ9D6Y7 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MsraQ9D6Y7 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MsraQ9D6Y7 1700125H20Rik-202ENSMUST00000100681 687 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MsraQ9D6Y7 Mir671-201ENSMUST00000102432 98 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
MsraQ9D6Y7 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MsraQ9D6Y7 Ralyl-202ENSMUST00000108373 267 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
MsraQ9D6Y7 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
MsraQ9D6Y7 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
MsraQ9D6Y7 Gm16876-201ENSMUST00000151945 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MsraQ9D6Y7 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MsraQ9D6Y7 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
MsraQ9D6Y7 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
MsraQ9D6Y7 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
MsraQ9D6Y7 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MsraQ9D6Y7 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MsraQ9D6Y7 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MsraQ9D6Y7 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MsraQ9D6Y7 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
MsraQ9D6Y7 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MsraQ9D6Y7 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MsraQ9D6Y7 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MsraQ9D6Y7 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MsraQ9D6Y7 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
MsraQ9D6Y7 Ndufaf1-203ENSMUST00000110802 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MsraQ9D6Y7 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MsraQ9D6Y7 Bmp4-202ENSMUST00000100676 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MsraQ9D6Y7 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
MsraQ9D6Y7 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MsraQ9D6Y7 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
MsraQ9D6Y7 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MsraQ9D6Y7 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MsraQ9D6Y7 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
MsraQ9D6Y7 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MsraQ9D6Y7 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MsraQ9D6Y7 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MsraQ9D6Y7 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MsraQ9D6Y7 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MsraQ9D6Y7 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MsraQ9D6Y7 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MsraQ9D6Y7 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MsraQ9D6Y7 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
MsraQ9D6Y7 Tcf7l2-204ENSMUST00000111649 982 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MsraQ9D6Y7 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
MsraQ9D6Y7 Ndufc2-202ENSMUST00000149122 470 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
MsraQ9D6Y7 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
MsraQ9D6Y7 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
MsraQ9D6Y7 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MsraQ9D6Y7 Clec7a-202ENSMUST00000184581 707 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
MsraQ9D6Y7 A930036K24Rik-201ENSMUST00000194146 1200 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
MsraQ9D6Y7 Pcgf5-204ENSMUST00000224772 1266 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
MsraQ9D6Y7 Zmiz1os1-202ENSMUST00000225188 1223 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
MsraQ9D6Y7 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MsraQ9D6Y7 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MsraQ9D6Y7 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MsraQ9D6Y7 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MsraQ9D6Y7 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
MsraQ9D6Y7 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MsraQ9D6Y7 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MsraQ9D6Y7 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MsraQ9D6Y7 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
MsraQ9D6Y7 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MsraQ9D6Y7 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
MsraQ9D6Y7 4932431P20Rik-201ENSMUST00000098602 1340 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
MsraQ9D6Y7 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MsraQ9D6Y7 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
MsraQ9D6Y7 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
MsraQ9D6Y7 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
MsraQ9D6Y7 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
MsraQ9D6Y7 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
MsraQ9D6Y7 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
MsraQ9D6Y7 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
MsraQ9D6Y7 Fyn-207ENSMUST00000146287 2135 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
MsraQ9D6Y7 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
MsraQ9D6Y7 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
MsraQ9D6Y7 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
MsraQ9D6Y7 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
MsraQ9D6Y7 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
MsraQ9D6Y7 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
MsraQ9D6Y7 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
MsraQ9D6Y7 Nudt7-204ENSMUST00000134593 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
MsraQ9D6Y7 Gm15409-201ENSMUST00000135240 520 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
MsraQ9D6Y7 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms