Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6W8

Borcs6, BLOC-1-related complex subunit 6, mousemouse

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Length 360 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Borcs6Q9D6W8 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Borcs6Q9D6W8 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Borcs6Q9D6W8 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Borcs6Q9D6W8 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Borcs6Q9D6W8 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Borcs6Q9D6W8 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Borcs6Q9D6W8 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Borcs6Q9D6W8 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Borcs6Q9D6W8 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Borcs6Q9D6W8 Gm28215-201ENSMUST00000186146 346 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Borcs6Q9D6W8 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Borcs6Q9D6W8 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Borcs6Q9D6W8 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Borcs6Q9D6W8 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Borcs6Q9D6W8 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Borcs6Q9D6W8 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Borcs6Q9D6W8 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Borcs6Q9D6W8 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Borcs6Q9D6W8 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Borcs6Q9D6W8 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Borcs6Q9D6W8 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Borcs6Q9D6W8 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Borcs6Q9D6W8 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Borcs6Q9D6W8 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Borcs6Q9D6W8 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Borcs6Q9D6W8 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Borcs6Q9D6W8 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Borcs6Q9D6W8 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Borcs6Q9D6W8 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Borcs6Q9D6W8 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Borcs6Q9D6W8 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Borcs6Q9D6W8 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Borcs6Q9D6W8 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Borcs6Q9D6W8 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Borcs6Q9D6W8 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Borcs6Q9D6W8 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Borcs6Q9D6W8 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Borcs6Q9D6W8 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Borcs6Q9D6W8 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Borcs6Q9D6W8 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Borcs6Q9D6W8 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Borcs6Q9D6W8 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Borcs6Q9D6W8 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Borcs6Q9D6W8 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Borcs6Q9D6W8 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Borcs6Q9D6W8 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Borcs6Q9D6W8 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Borcs6Q9D6W8 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Borcs6Q9D6W8 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Borcs6Q9D6W8 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Borcs6Q9D6W8 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Borcs6Q9D6W8 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Borcs6Q9D6W8 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Borcs6Q9D6W8 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Borcs6Q9D6W8 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Borcs6Q9D6W8 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Borcs6Q9D6W8 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
Borcs6Q9D6W8 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
Borcs6Q9D6W8 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Borcs6Q9D6W8 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Borcs6Q9D6W8 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Borcs6Q9D6W8 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Borcs6Q9D6W8 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Borcs6Q9D6W8 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Borcs6Q9D6W8 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Borcs6Q9D6W8 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
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Borcs6Q9D6W8 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Borcs6Q9D6W8 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
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Borcs6Q9D6W8 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Borcs6Q9D6W8 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Borcs6Q9D6W8 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Borcs6Q9D6W8 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Borcs6Q9D6W8 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Borcs6Q9D6W8 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Borcs6Q9D6W8 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Borcs6Q9D6W8 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Borcs6Q9D6W8 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Borcs6Q9D6W8 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Borcs6Q9D6W8 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Borcs6Q9D6W8 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Borcs6Q9D6W8 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Borcs6Q9D6W8 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Borcs6Q9D6W8 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Borcs6Q9D6W8 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Borcs6Q9D6W8 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Borcs6Q9D6W8 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Borcs6Q9D6W8 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Borcs6Q9D6W8 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Borcs6Q9D6W8 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Borcs6Q9D6W8 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Borcs6Q9D6W8 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Borcs6Q9D6W8 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Borcs6Q9D6W8 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Borcs6Q9D6W8 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Borcs6Q9D6W8 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Borcs6Q9D6W8 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Borcs6Q9D6W8 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Borcs6Q9D6W8 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms