Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Z5

Prame, Preferentially-expressed antigen in melanoma, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrameQ9D4Z5 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PrameQ9D4Z5 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PrameQ9D4Z5 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PrameQ9D4Z5 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PrameQ9D4Z5 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PrameQ9D4Z5 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PrameQ9D4Z5 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PrameQ9D4Z5 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PrameQ9D4Z5 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PrameQ9D4Z5 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PrameQ9D4Z5 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PrameQ9D4Z5 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PrameQ9D4Z5 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PrameQ9D4Z5 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PrameQ9D4Z5 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
PrameQ9D4Z5 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PrameQ9D4Z5 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PrameQ9D4Z5 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PrameQ9D4Z5 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
PrameQ9D4Z5 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PrameQ9D4Z5 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PrameQ9D4Z5 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PrameQ9D4Z5 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PrameQ9D4Z5 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PrameQ9D4Z5 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PrameQ9D4Z5 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PrameQ9D4Z5 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PrameQ9D4Z5 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PrameQ9D4Z5 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PrameQ9D4Z5 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PrameQ9D4Z5 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
PrameQ9D4Z5 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PrameQ9D4Z5 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PrameQ9D4Z5 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PrameQ9D4Z5 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PrameQ9D4Z5 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
PrameQ9D4Z5 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PrameQ9D4Z5 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
PrameQ9D4Z5 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PrameQ9D4Z5 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PrameQ9D4Z5 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
PrameQ9D4Z5 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
PrameQ9D4Z5 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PrameQ9D4Z5 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
PrameQ9D4Z5 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
PrameQ9D4Z5 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PrameQ9D4Z5 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PrameQ9D4Z5 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PrameQ9D4Z5 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PrameQ9D4Z5 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
PrameQ9D4Z5 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PrameQ9D4Z5 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PrameQ9D4Z5 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PrameQ9D4Z5 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PrameQ9D4Z5 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PrameQ9D4Z5 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
PrameQ9D4Z5 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PrameQ9D4Z5 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PrameQ9D4Z5 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PrameQ9D4Z5 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PrameQ9D4Z5 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PrameQ9D4Z5 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PrameQ9D4Z5 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PrameQ9D4Z5 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PrameQ9D4Z5 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
PrameQ9D4Z5 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
PrameQ9D4Z5 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PrameQ9D4Z5 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
PrameQ9D4Z5 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
PrameQ9D4Z5 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
PrameQ9D4Z5 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
PrameQ9D4Z5 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PrameQ9D4Z5 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
PrameQ9D4Z5 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PrameQ9D4Z5 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PrameQ9D4Z5 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PrameQ9D4Z5 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PrameQ9D4Z5 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
PrameQ9D4Z5 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
PrameQ9D4Z5 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
PrameQ9D4Z5 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PrameQ9D4Z5 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PrameQ9D4Z5 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PrameQ9D4Z5 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PrameQ9D4Z5 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PrameQ9D4Z5 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PrameQ9D4Z5 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PrameQ9D4Z5 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PrameQ9D4Z5 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PrameQ9D4Z5 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PrameQ9D4Z5 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PrameQ9D4Z5 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PrameQ9D4Z5 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PrameQ9D4Z5 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PrameQ9D4Z5 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PrameQ9D4Z5 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PrameQ9D4Z5 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PrameQ9D4Z5 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PrameQ9D4Z5 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PrameQ9D4Z5 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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