Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2R4

Tmed11, Transmembrane emp24 domain-containing protein 11, mousemouse

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed11Q9D2R4 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Tmed11Q9D2R4 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Tmed11Q9D2R4 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Tmed11Q9D2R4 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
Tmed11Q9D2R4 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Tmed11Q9D2R4 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Tmed11Q9D2R4 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Tmed11Q9D2R4 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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Tmed11Q9D2R4 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmed11Q9D2R4 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmed11Q9D2R4 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmed11Q9D2R4 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
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Tmed11Q9D2R4 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmed11Q9D2R4 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmed11Q9D2R4 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
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Tmed11Q9D2R4 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
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Tmed11Q9D2R4 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmed11Q9D2R4 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmed11Q9D2R4 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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Tmed11Q9D2R4 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmed11Q9D2R4 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmed11Q9D2R4 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmed11Q9D2R4 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmed11Q9D2R4 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmed11Q9D2R4 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmed11Q9D2R4 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmed11Q9D2R4 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmed11Q9D2R4 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmed11Q9D2R4 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmed11Q9D2R4 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
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Tmed11Q9D2R4 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmed11Q9D2R4 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmed11Q9D2R4 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Tmed11Q9D2R4 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmed11Q9D2R4 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmed11Q9D2R4 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmed11Q9D2R4 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmed11Q9D2R4 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmed11Q9D2R4 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmed11Q9D2R4 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmed11Q9D2R4 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Tmed11Q9D2R4 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmed11Q9D2R4 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmed11Q9D2R4 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmed11Q9D2R4 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Tmed11Q9D2R4 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmed11Q9D2R4 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmed11Q9D2R4 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmed11Q9D2R4 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmed11Q9D2R4 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmed11Q9D2R4 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmed11Q9D2R4 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmed11Q9D2R4 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmed11Q9D2R4 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmed11Q9D2R4 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmed11Q9D2R4 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmed11Q9D2R4 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmed11Q9D2R4 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmed11Q9D2R4 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmed11Q9D2R4 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tmed11Q9D2R4 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmed11Q9D2R4 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmed11Q9D2R4 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmed11Q9D2R4 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmed11Q9D2R4 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmed11Q9D2R4 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmed11Q9D2R4 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmed11Q9D2R4 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmed11Q9D2R4 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmed11Q9D2R4 Akap12-202ENSMUST00000215696 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmed11Q9D2R4 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmed11Q9D2R4 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmed11Q9D2R4 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmed11Q9D2R4 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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