Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2H8

Fndc8, Fibronectin type III domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc8Q9D2H8 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.9 ms