Protein–RNA interactions for Protein: Q9D162

Ccdc167, Coiled-coil domain-containing protein 167, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc167Q9D162 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc167Q9D162 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ccdc167Q9D162 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc167Q9D162 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc167Q9D162 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc167Q9D162 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc167Q9D162 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc167Q9D162 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc167Q9D162 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc167Q9D162 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc167Q9D162 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc167Q9D162 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc167Q9D162 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc167Q9D162 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc167Q9D162 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc167Q9D162 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc167Q9D162 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc167Q9D162 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc167Q9D162 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc167Q9D162 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc167Q9D162 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc167Q9D162 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc167Q9D162 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc167Q9D162 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc167Q9D162 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc167Q9D162 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc167Q9D162 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc167Q9D162 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc167Q9D162 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc167Q9D162 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc167Q9D162 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc167Q9D162 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc167Q9D162 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc167Q9D162 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc167Q9D162 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc167Q9D162 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc167Q9D162 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc167Q9D162 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc167Q9D162 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc167Q9D162 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc167Q9D162 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc167Q9D162 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc167Q9D162 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc167Q9D162 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc167Q9D162 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccdc167Q9D162 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ccdc167Q9D162 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ccdc167Q9D162 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Ccdc167Q9D162 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ccdc167Q9D162 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ccdc167Q9D162 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ccdc167Q9D162 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ccdc167Q9D162 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ccdc167Q9D162 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ccdc167Q9D162 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc167Q9D162 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc167Q9D162 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc167Q9D162 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc167Q9D162 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc167Q9D162 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc167Q9D162 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc167Q9D162 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc167Q9D162 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc167Q9D162 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc167Q9D162 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc167Q9D162 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc167Q9D162 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc167Q9D162 Mtf1-202ENSMUST00000106193 7554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc167Q9D162 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc167Q9D162 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc167Q9D162 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc167Q9D162 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc167Q9D162 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc167Q9D162 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc167Q9D162 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc167Q9D162 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc167Q9D162 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc167Q9D162 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc167Q9D162 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc167Q9D162 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc167Q9D162 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc167Q9D162 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc167Q9D162 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc167Q9D162 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc167Q9D162 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc167Q9D162 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc167Q9D162 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc167Q9D162 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc167Q9D162 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc167Q9D162 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc167Q9D162 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc167Q9D162 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc167Q9D162 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc167Q9D162 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc167Q9D162 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc167Q9D162 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc167Q9D162 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc167Q9D162 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc167Q9D162 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccdc167Q9D162 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms