Protein–RNA interactions for Protein: Q9D114

Hddc3, Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc3Q9D114 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hddc3Q9D114 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hddc3Q9D114 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hddc3Q9D114 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hddc3Q9D114 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hddc3Q9D114 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hddc3Q9D114 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hddc3Q9D114 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hddc3Q9D114 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hddc3Q9D114 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hddc3Q9D114 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hddc3Q9D114 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hddc3Q9D114 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Hddc3Q9D114 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hddc3Q9D114 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Hddc3Q9D114 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hddc3Q9D114 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hddc3Q9D114 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hddc3Q9D114 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hddc3Q9D114 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hddc3Q9D114 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hddc3Q9D114 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hddc3Q9D114 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hddc3Q9D114 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hddc3Q9D114 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hddc3Q9D114 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hddc3Q9D114 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hddc3Q9D114 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hddc3Q9D114 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hddc3Q9D114 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Hddc3Q9D114 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hddc3Q9D114 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hddc3Q9D114 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Hddc3Q9D114 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Hddc3Q9D114 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hddc3Q9D114 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hddc3Q9D114 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hddc3Q9D114 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hddc3Q9D114 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hddc3Q9D114 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hddc3Q9D114 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Hddc3Q9D114 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hddc3Q9D114 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hddc3Q9D114 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Hddc3Q9D114 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Hddc3Q9D114 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Hddc3Q9D114 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Hddc3Q9D114 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Hddc3Q9D114 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hddc3Q9D114 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hddc3Q9D114 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hddc3Q9D114 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hddc3Q9D114 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hddc3Q9D114 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hddc3Q9D114 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hddc3Q9D114 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hddc3Q9D114 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Hddc3Q9D114 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hddc3Q9D114 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hddc3Q9D114 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hddc3Q9D114 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hddc3Q9D114 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Hddc3Q9D114 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hddc3Q9D114 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hddc3Q9D114 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hddc3Q9D114 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hddc3Q9D114 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hddc3Q9D114 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hddc3Q9D114 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hddc3Q9D114 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hddc3Q9D114 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hddc3Q9D114 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Hddc3Q9D114 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hddc3Q9D114 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hddc3Q9D114 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hddc3Q9D114 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hddc3Q9D114 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hddc3Q9D114 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Hddc3Q9D114 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hddc3Q9D114 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hddc3Q9D114 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hddc3Q9D114 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hddc3Q9D114 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hddc3Q9D114 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hddc3Q9D114 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hddc3Q9D114 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Hddc3Q9D114 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Hddc3Q9D114 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hddc3Q9D114 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hddc3Q9D114 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hddc3Q9D114 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hddc3Q9D114 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Hddc3Q9D114 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Hddc3Q9D114 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Hddc3Q9D114 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hddc3Q9D114 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hddc3Q9D114 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Hddc3Q9D114 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hddc3Q9D114 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hddc3Q9D114 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms