Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXV1

Sdhd, Succinate dehydrogenase [ubiquinone] cytochrome b small subunit, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SdhdQ9CXV1 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
SdhdQ9CXV1 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SdhdQ9CXV1 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
SdhdQ9CXV1 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
SdhdQ9CXV1 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SdhdQ9CXV1 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SdhdQ9CXV1 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
SdhdQ9CXV1 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SdhdQ9CXV1 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SdhdQ9CXV1 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SdhdQ9CXV1 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SdhdQ9CXV1 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SdhdQ9CXV1 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.75
SdhdQ9CXV1 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SdhdQ9CXV1 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SdhdQ9CXV1 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SdhdQ9CXV1 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SdhdQ9CXV1 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
SdhdQ9CXV1 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SdhdQ9CXV1 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SdhdQ9CXV1 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SdhdQ9CXV1 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SdhdQ9CXV1 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
SdhdQ9CXV1 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SdhdQ9CXV1 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SdhdQ9CXV1 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SdhdQ9CXV1 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SdhdQ9CXV1 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SdhdQ9CXV1 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SdhdQ9CXV1 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SdhdQ9CXV1 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SdhdQ9CXV1 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
SdhdQ9CXV1 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
SdhdQ9CXV1 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
SdhdQ9CXV1 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
SdhdQ9CXV1 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
SdhdQ9CXV1 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
SdhdQ9CXV1 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SdhdQ9CXV1 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
SdhdQ9CXV1 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SdhdQ9CXV1 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SdhdQ9CXV1 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
SdhdQ9CXV1 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
SdhdQ9CXV1 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SdhdQ9CXV1 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
SdhdQ9CXV1 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
SdhdQ9CXV1 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SdhdQ9CXV1 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SdhdQ9CXV1 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SdhdQ9CXV1 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SdhdQ9CXV1 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SdhdQ9CXV1 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SdhdQ9CXV1 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
SdhdQ9CXV1 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SdhdQ9CXV1 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SdhdQ9CXV1 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
SdhdQ9CXV1 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SdhdQ9CXV1 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
SdhdQ9CXV1 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SdhdQ9CXV1 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SdhdQ9CXV1 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
SdhdQ9CXV1 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SdhdQ9CXV1 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
SdhdQ9CXV1 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SdhdQ9CXV1 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SdhdQ9CXV1 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SdhdQ9CXV1 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SdhdQ9CXV1 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SdhdQ9CXV1 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SdhdQ9CXV1 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
SdhdQ9CXV1 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SdhdQ9CXV1 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
SdhdQ9CXV1 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
SdhdQ9CXV1 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SdhdQ9CXV1 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
SdhdQ9CXV1 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
SdhdQ9CXV1 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
SdhdQ9CXV1 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
SdhdQ9CXV1 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
SdhdQ9CXV1 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
SdhdQ9CXV1 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
SdhdQ9CXV1 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SdhdQ9CXV1 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
SdhdQ9CXV1 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SdhdQ9CXV1 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
SdhdQ9CXV1 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
SdhdQ9CXV1 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SdhdQ9CXV1 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
SdhdQ9CXV1 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
SdhdQ9CXV1 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
SdhdQ9CXV1 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
SdhdQ9CXV1 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
SdhdQ9CXV1 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SdhdQ9CXV1 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
SdhdQ9CXV1 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SdhdQ9CXV1 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
SdhdQ9CXV1 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SdhdQ9CXV1 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SdhdQ9CXV1 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
SdhdQ9CXV1 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms