Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM4

Pfdn1, Prefoldin subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn1Q9CWM4 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Pdp2-201ENSMUST00000059588 5692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Hoxa1-201ENSMUST00000000964 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Flcn-203ENSMUST00000102697 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Atg16l2-201ENSMUST00000120267 6459 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Mettl14-204ENSMUST00000174323 4202 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Dzip1l-203ENSMUST00000112885 4350 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Bcl7a-202ENSMUST00000117971 4642 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Gm5703-201ENSMUST00000186658 3973 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Bcl9-201ENSMUST00000046521 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Arhgap24-203ENSMUST00000094559 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Tia1-206ENSMUST00000113713 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Bmpr2-201ENSMUST00000087435 12899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Akap12-202ENSMUST00000215696 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Thsd7b-202ENSMUST00000073527 6213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Tcp10a-202ENSMUST00000128533 2589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Gmps-201ENSMUST00000029405 8105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Ap2b1-201ENSMUST00000018875 5625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Tardbp-210ENSMUST00000172073 6513 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Adar-204ENSMUST00000118341 2399 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Fbrs-201ENSMUST00000048896 2650 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Ahrr-201ENSMUST00000022059 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Son-204ENSMUST00000119368 7529 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Scnn1b-201ENSMUST00000033161 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Ddah1-202ENSMUST00000120310 2291 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 AC154171.2-201ENSMUST00000225219 2652 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Trp73-205ENSMUST00000133533 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Elf4-201ENSMUST00000033429 5847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Slc45a4-202ENSMUST00000076224 4240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Limd1-201ENSMUST00000026269 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Rtl1-201ENSMUST00000149046 6358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Faim2-201ENSMUST00000023750 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pfdn1Q9CWM4 Gm26868-201ENSMUST00000181927 2655 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms