Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE8

RTRAF, RNA transcription, translation and transport factor protein, mousemouse

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTRAFQ9CQE8 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
RTRAFQ9CQE8 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
RTRAFQ9CQE8 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
RTRAFQ9CQE8 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
RTRAFQ9CQE8 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
RTRAFQ9CQE8 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
RTRAFQ9CQE8 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
RTRAFQ9CQE8 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
RTRAFQ9CQE8 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
RTRAFQ9CQE8 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
RTRAFQ9CQE8 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
RTRAFQ9CQE8 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
RTRAFQ9CQE8 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
RTRAFQ9CQE8 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
RTRAFQ9CQE8 Pnma2-201ENSMUST00000089236 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
RTRAFQ9CQE8 Ogfod1-202ENSMUST00000093301 5141 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
RTRAFQ9CQE8 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
RTRAFQ9CQE8 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
RTRAFQ9CQE8 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
RTRAFQ9CQE8 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
RTRAFQ9CQE8 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
RTRAFQ9CQE8 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
RTRAFQ9CQE8 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
RTRAFQ9CQE8 Astn1-205ENSMUST00000193042 7248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
RTRAFQ9CQE8 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
RTRAFQ9CQE8 Slco5a1-202ENSMUST00000115403 8509 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
RTRAFQ9CQE8 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
RTRAFQ9CQE8 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
RTRAFQ9CQE8 Frmpd3-203ENSMUST00000208130 7314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
RTRAFQ9CQE8 Clip1-203ENSMUST00000111561 5883 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
RTRAFQ9CQE8 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC10□□□□□ -0.81
RTRAFQ9CQE8 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
RTRAFQ9CQE8 Atad5-201ENSMUST00000017694 7272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
RTRAFQ9CQE8 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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RTRAFQ9CQE8 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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RTRAFQ9CQE8 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
RTRAFQ9CQE8 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
RTRAFQ9CQE8 Setbp1-201ENSMUST00000025430 9953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
RTRAFQ9CQE8 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC10□□□□□ -0.81
RTRAFQ9CQE8 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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RTRAFQ9CQE8 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
RTRAFQ9CQE8 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
RTRAFQ9CQE8 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC10□□□□□ -0.81
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RTRAFQ9CQE8 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
RTRAFQ9CQE8 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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RTRAFQ9CQE8 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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RTRAFQ9CQE8 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC10□□□□□ -0.81
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RTRAFQ9CQE8 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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RTRAFQ9CQE8 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
RTRAFQ9CQE8 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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RTRAFQ9CQE8 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
RTRAFQ9CQE8 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
RTRAFQ9CQE8 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
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RTRAFQ9CQE8 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
RTRAFQ9CQE8 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
RTRAFQ9CQE8 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
RTRAFQ9CQE8 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
RTRAFQ9CQE8 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
RTRAFQ9CQE8 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
RTRAFQ9CQE8 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
RTRAFQ9CQE8 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
RTRAFQ9CQE8 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
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RTRAFQ9CQE8 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
RTRAFQ9CQE8 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
RTRAFQ9CQE8 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
RTRAFQ9CQE8 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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