Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ02

Commd4, COMM domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Commd4Q9CQ02 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Commd4Q9CQ02 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Commd4Q9CQ02 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Commd4Q9CQ02 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Commd4Q9CQ02 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Commd4Q9CQ02 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Commd4Q9CQ02 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Commd4Q9CQ02 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Commd4Q9CQ02 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Commd4Q9CQ02 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Commd4Q9CQ02 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Commd4Q9CQ02 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Commd4Q9CQ02 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Commd4Q9CQ02 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Commd4Q9CQ02 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Commd4Q9CQ02 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Commd4Q9CQ02 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Commd4Q9CQ02 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Commd4Q9CQ02 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Commd4Q9CQ02 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Commd4Q9CQ02 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Commd4Q9CQ02 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Commd4Q9CQ02 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Commd4Q9CQ02 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Commd4Q9CQ02 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Commd4Q9CQ02 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Commd4Q9CQ02 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Commd4Q9CQ02 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Commd4Q9CQ02 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Commd4Q9CQ02 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Commd4Q9CQ02 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Commd4Q9CQ02 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Commd4Q9CQ02 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Commd4Q9CQ02 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Commd4Q9CQ02 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Commd4Q9CQ02 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Commd4Q9CQ02 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Commd4Q9CQ02 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Commd4Q9CQ02 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Commd4Q9CQ02 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Commd4Q9CQ02 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Commd4Q9CQ02 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Commd4Q9CQ02 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Commd4Q9CQ02 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Commd4Q9CQ02 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Commd4Q9CQ02 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Commd4Q9CQ02 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Commd4Q9CQ02 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Commd4Q9CQ02 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Commd4Q9CQ02 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Commd4Q9CQ02 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Commd4Q9CQ02 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Commd4Q9CQ02 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Commd4Q9CQ02 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Commd4Q9CQ02 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.1 ms