Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg3Q9CPX6 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg3Q9CPX6 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg3Q9CPX6 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg3Q9CPX6 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg3Q9CPX6 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg3Q9CPX6 Gm4993-201ENSMUST00000118719 1174 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg3Q9CPX6 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg3Q9CPX6 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg3Q9CPX6 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg3Q9CPX6 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg3Q9CPX6 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg3Q9CPX6 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg3Q9CPX6 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg3Q9CPX6 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg3Q9CPX6 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg3Q9CPX6 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg3Q9CPX6 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg3Q9CPX6 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg3Q9CPX6 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg3Q9CPX6 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg3Q9CPX6 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg3Q9CPX6 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg3Q9CPX6 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg3Q9CPX6 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg3Q9CPX6 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg3Q9CPX6 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg3Q9CPX6 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg3Q9CPX6 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg3Q9CPX6 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg3Q9CPX6 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg3Q9CPX6 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg3Q9CPX6 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg3Q9CPX6 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg3Q9CPX6 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg3Q9CPX6 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg3Q9CPX6 Gm17135-201ENSMUST00000167009 564 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg3Q9CPX6 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg3Q9CPX6 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg3Q9CPX6 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg3Q9CPX6 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg3Q9CPX6 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg3Q9CPX6 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg3Q9CPX6 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg3Q9CPX6 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg3Q9CPX6 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg3Q9CPX6 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg3Q9CPX6 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg3Q9CPX6 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg3Q9CPX6 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg3Q9CPX6 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atg3Q9CPX6 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg3Q9CPX6 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg3Q9CPX6 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg3Q9CPX6 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg3Q9CPX6 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg3Q9CPX6 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg3Q9CPX6 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg3Q9CPX6 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg3Q9CPX6 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg3Q9CPX6 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg3Q9CPX6 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg3Q9CPX6 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg3Q9CPX6 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg3Q9CPX6 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg3Q9CPX6 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg3Q9CPX6 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg3Q9CPX6 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg3Q9CPX6 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg3Q9CPX6 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg3Q9CPX6 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg3Q9CPX6 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg3Q9CPX6 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg3Q9CPX6 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg3Q9CPX6 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg3Q9CPX6 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg3Q9CPX6 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg3Q9CPX6 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg3Q9CPX6 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg3Q9CPX6 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg3Q9CPX6 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg3Q9CPX6 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg3Q9CPX6 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg3Q9CPX6 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg3Q9CPX6 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg3Q9CPX6 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg3Q9CPX6 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg3Q9CPX6 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg3Q9CPX6 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg3Q9CPX6 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atg3Q9CPX6 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg3Q9CPX6 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg3Q9CPX6 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg3Q9CPX6 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg3Q9CPX6 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg3Q9CPX6 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg3Q9CPX6 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg3Q9CPX6 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg3Q9CPX6 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg3Q9CPX6 Selenot-ps-201ENSMUST00000119098 593 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms