Protein–RNA interactions for Protein: Q99N95

Mrpl3, 39S ribosomal protein L3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl3Q99N95 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl3Q99N95 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl3Q99N95 Bcl9l-203ENSMUST00000218183 6771 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl3Q99N95 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl3Q99N95 Cln8-201ENSMUST00000027554 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl3Q99N95 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl3Q99N95 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl3Q99N95 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl3Q99N95 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl3Q99N95 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl3Q99N95 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl3Q99N95 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl3Q99N95 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl3Q99N95 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl3Q99N95 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl3Q99N95 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl3Q99N95 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl3Q99N95 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl3Q99N95 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl3Q99N95 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl3Q99N95 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl3Q99N95 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl3Q99N95 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl3Q99N95 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl3Q99N95 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl3Q99N95 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl3Q99N95 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl3Q99N95 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl3Q99N95 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl3Q99N95 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl3Q99N95 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl3Q99N95 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl3Q99N95 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl3Q99N95 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl3Q99N95 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl3Q99N95 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl3Q99N95 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl3Q99N95 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl3Q99N95 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl3Q99N95 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl3Q99N95 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl3Q99N95 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl3Q99N95 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl3Q99N95 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl3Q99N95 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl3Q99N95 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl3Q99N95 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl3Q99N95 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl3Q99N95 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl3Q99N95 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl3Q99N95 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl3Q99N95 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl3Q99N95 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl3Q99N95 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl3Q99N95 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl3Q99N95 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl3Q99N95 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl3Q99N95 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl3Q99N95 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl3Q99N95 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl3Q99N95 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl3Q99N95 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl3Q99N95 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl3Q99N95 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl3Q99N95 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl3Q99N95 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl3Q99N95 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl3Q99N95 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl3Q99N95 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl3Q99N95 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl3Q99N95 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl3Q99N95 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl3Q99N95 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl3Q99N95 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl3Q99N95 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl3Q99N95 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl3Q99N95 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl3Q99N95 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl3Q99N95 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl3Q99N95 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl3Q99N95 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl3Q99N95 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl3Q99N95 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl3Q99N95 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl3Q99N95 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl3Q99N95 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl3Q99N95 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl3Q99N95 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl3Q99N95 Dock6-207ENSMUST00000217336 6880 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl3Q99N95 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl3Q99N95 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl3Q99N95 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl3Q99N95 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl3Q99N95 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl3Q99N95 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl3Q99N95 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl3Q99N95 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl3Q99N95 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl3Q99N95 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Mrpl3Q99N95 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.6 ms