Protein–RNA interactions for Protein: Q99N13

Hdac9, Histone deacetylase 9, mousemouse

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Hdac9Q99N13 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Hdac9Q99N13 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Hdac9Q99N13 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hdac9Q99N13 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hdac9Q99N13 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Hdac9Q99N13 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Hdac9Q99N13 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Hdac9Q99N13 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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