Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Pacsin3Q99JB8 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Pacsin3Q99JB8 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Pacsin3Q99JB8 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pacsin3Q99JB8 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pacsin3Q99JB8 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pacsin3Q99JB8 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pacsin3Q99JB8 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
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Pacsin3Q99JB8 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pacsin3Q99JB8 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pacsin3Q99JB8 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pacsin3Q99JB8 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pacsin3Q99JB8 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pacsin3Q99JB8 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pacsin3Q99JB8 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pacsin3Q99JB8 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pacsin3Q99JB8 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pacsin3Q99JB8 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Pacsin3Q99JB8 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Pacsin3Q99JB8 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Pacsin3Q99JB8 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Pacsin3Q99JB8 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
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Pacsin3Q99JB8 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pacsin3Q99JB8 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Pacsin3Q99JB8 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Pacsin3Q99JB8 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pacsin3Q99JB8 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pacsin3Q99JB8 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pacsin3Q99JB8 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pacsin3Q99JB8 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pacsin3Q99JB8 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pacsin3Q99JB8 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pacsin3Q99JB8 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pacsin3Q99JB8 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pacsin3Q99JB8 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pacsin3Q99JB8 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pacsin3Q99JB8 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pacsin3Q99JB8 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pacsin3Q99JB8 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pacsin3Q99JB8 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pacsin3Q99JB8 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pacsin3Q99JB8 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pacsin3Q99JB8 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pacsin3Q99JB8 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pacsin3Q99JB8 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pacsin3Q99JB8 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pacsin3Q99JB8 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Pacsin3Q99JB8 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
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