Protein–RNA interactions for Protein: Q923L3

Csmd1, CUB and sushi domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd1Q923L3 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Gm12000-201ENSMUST00000132007 629 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Gm4868-201ENSMUST00000164138 789 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Naa10-202ENSMUST00000096316 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Gm12681-201ENSMUST00000132337 700 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Isca2-206ENSMUST00000222449 374 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Gm11986-201ENSMUST00000149481 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Creb3l4-201ENSMUST00000029547 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Rpl23-201ENSMUST00000103146 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Ndufc2-202ENSMUST00000149122 470 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Pcgf5-204ENSMUST00000224772 1266 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Mphosph10-201ENSMUST00000032735 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Ighv1-76-201ENSMUST00000169155 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Tex33-203ENSMUST00000169575 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Ighv1-62-1-202ENSMUST00000171270 90 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Mitd1-201ENSMUST00000027257 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Tarm1-203ENSMUST00000203821 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Gm8197-202ENSMUST00000193422 934 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Rhno1-207ENSMUST00000223237 1081 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Prok2-201ENSMUST00000008273 594 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Gm13981-201ENSMUST00000122360 447 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Gm12666-201ENSMUST00000123179 764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Gm17944-201ENSMUST00000186351 643 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Gm18801-201ENSMUST00000186616 536 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Gm28901-201ENSMUST00000188810 474 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Cklf-210ENSMUST00000212939 737 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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