Protein–RNA interactions for Protein: Q91YH5

Atl3, Atlastin-3, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl3Q91YH5 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atl3Q91YH5 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atl3Q91YH5 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atl3Q91YH5 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atl3Q91YH5 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atl3Q91YH5 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atl3Q91YH5 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Atl3Q91YH5 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Atl3Q91YH5 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Atl3Q91YH5 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Atl3Q91YH5 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Atl3Q91YH5 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Atl3Q91YH5 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Atl3Q91YH5 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atl3Q91YH5 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atl3Q91YH5 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atl3Q91YH5 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atl3Q91YH5 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atl3Q91YH5 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Atl3Q91YH5 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atl3Q91YH5 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atl3Q91YH5 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atl3Q91YH5 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atl3Q91YH5 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atl3Q91YH5 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atl3Q91YH5 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atl3Q91YH5 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atl3Q91YH5 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Atl3Q91YH5 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atl3Q91YH5 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atl3Q91YH5 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Atl3Q91YH5 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atl3Q91YH5 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Atl3Q91YH5 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atl3Q91YH5 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atl3Q91YH5 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atl3Q91YH5 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atl3Q91YH5 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atl3Q91YH5 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atl3Q91YH5 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atl3Q91YH5 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atl3Q91YH5 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atl3Q91YH5 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Atl3Q91YH5 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atl3Q91YH5 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atl3Q91YH5 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atl3Q91YH5 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atl3Q91YH5 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atl3Q91YH5 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Atl3Q91YH5 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atl3Q91YH5 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atl3Q91YH5 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atl3Q91YH5 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atl3Q91YH5 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atl3Q91YH5 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atl3Q91YH5 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atl3Q91YH5 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Atl3Q91YH5 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atl3Q91YH5 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atl3Q91YH5 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atl3Q91YH5 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atl3Q91YH5 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atl3Q91YH5 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Atl3Q91YH5 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Atl3Q91YH5 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Atl3Q91YH5 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atl3Q91YH5 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atl3Q91YH5 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atl3Q91YH5 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atl3Q91YH5 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Atl3Q91YH5 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atl3Q91YH5 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atl3Q91YH5 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atl3Q91YH5 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atl3Q91YH5 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atl3Q91YH5 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atl3Q91YH5 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atl3Q91YH5 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Atl3Q91YH5 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atl3Q91YH5 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atl3Q91YH5 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atl3Q91YH5 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atl3Q91YH5 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Atl3Q91YH5 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atl3Q91YH5 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atl3Q91YH5 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atl3Q91YH5 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atl3Q91YH5 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atl3Q91YH5 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atl3Q91YH5 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atl3Q91YH5 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atl3Q91YH5 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Atl3Q91YH5 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atl3Q91YH5 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atl3Q91YH5 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atl3Q91YH5 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atl3Q91YH5 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atl3Q91YH5 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atl3Q91YH5 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atl3Q91YH5 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms