Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3I4

Myrip, Rab effector MyRIP, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MyripQ8K3I4 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
MyripQ8K3I4 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
MyripQ8K3I4 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC14□□□□□ -0.17
MyripQ8K3I4 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
MyripQ8K3I4 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
MyripQ8K3I4 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC14□□□□□ -0.17
MyripQ8K3I4 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
MyripQ8K3I4 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
MyripQ8K3I4 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
MyripQ8K3I4 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
MyripQ8K3I4 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
MyripQ8K3I4 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
MyripQ8K3I4 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
MyripQ8K3I4 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
MyripQ8K3I4 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
MyripQ8K3I4 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
MyripQ8K3I4 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
MyripQ8K3I4 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
MyripQ8K3I4 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC14□□□□□ -0.17
MyripQ8K3I4 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
MyripQ8K3I4 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
MyripQ8K3I4 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
MyripQ8K3I4 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
MyripQ8K3I4 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
MyripQ8K3I4 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
MyripQ8K3I4 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
MyripQ8K3I4 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
MyripQ8K3I4 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
MyripQ8K3I4 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
MyripQ8K3I4 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
MyripQ8K3I4 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
MyripQ8K3I4 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
MyripQ8K3I4 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
MyripQ8K3I4 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
MyripQ8K3I4 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
MyripQ8K3I4 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
MyripQ8K3I4 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
MyripQ8K3I4 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
MyripQ8K3I4 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
MyripQ8K3I4 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
MyripQ8K3I4 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
MyripQ8K3I4 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
MyripQ8K3I4 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
MyripQ8K3I4 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
MyripQ8K3I4 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
MyripQ8K3I4 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
MyripQ8K3I4 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
MyripQ8K3I4 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
MyripQ8K3I4 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
MyripQ8K3I4 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
MyripQ8K3I4 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
MyripQ8K3I4 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
MyripQ8K3I4 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
MyripQ8K3I4 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
MyripQ8K3I4 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
MyripQ8K3I4 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
MyripQ8K3I4 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
MyripQ8K3I4 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
MyripQ8K3I4 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
MyripQ8K3I4 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
MyripQ8K3I4 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
MyripQ8K3I4 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
MyripQ8K3I4 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
MyripQ8K3I4 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
MyripQ8K3I4 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
MyripQ8K3I4 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
MyripQ8K3I4 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
MyripQ8K3I4 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
MyripQ8K3I4 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
MyripQ8K3I4 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
MyripQ8K3I4 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
MyripQ8K3I4 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
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MyripQ8K3I4 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
MyripQ8K3I4 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
MyripQ8K3I4 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
MyripQ8K3I4 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
MyripQ8K3I4 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
MyripQ8K3I4 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
MyripQ8K3I4 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
MyripQ8K3I4 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
MyripQ8K3I4 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
MyripQ8K3I4 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
MyripQ8K3I4 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
MyripQ8K3I4 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
MyripQ8K3I4 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
MyripQ8K3I4 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
MyripQ8K3I4 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
MyripQ8K3I4 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
MyripQ8K3I4 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
MyripQ8K3I4 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
MyripQ8K3I4 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
MyripQ8K3I4 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
MyripQ8K3I4 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
MyripQ8K3I4 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
MyripQ8K3I4 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
MyripQ8K3I4 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
MyripQ8K3I4 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
MyripQ8K3I4 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
MyripQ8K3I4 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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