Protein–RNA interactions for Protein: Q8K243

Trim68, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM68, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim68Q8K243 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim68Q8K243 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim68Q8K243 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim68Q8K243 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim68Q8K243 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim68Q8K243 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim68Q8K243 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim68Q8K243 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim68Q8K243 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim68Q8K243 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim68Q8K243 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim68Q8K243 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim68Q8K243 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim68Q8K243 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim68Q8K243 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim68Q8K243 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim68Q8K243 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim68Q8K243 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim68Q8K243 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim68Q8K243 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim68Q8K243 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim68Q8K243 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim68Q8K243 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim68Q8K243 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim68Q8K243 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim68Q8K243 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim68Q8K243 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim68Q8K243 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim68Q8K243 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim68Q8K243 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim68Q8K243 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim68Q8K243 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim68Q8K243 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim68Q8K243 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim68Q8K243 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim68Q8K243 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim68Q8K243 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim68Q8K243 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim68Q8K243 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim68Q8K243 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim68Q8K243 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim68Q8K243 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim68Q8K243 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim68Q8K243 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim68Q8K243 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trim68Q8K243 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim68Q8K243 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim68Q8K243 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim68Q8K243 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim68Q8K243 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim68Q8K243 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim68Q8K243 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim68Q8K243 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim68Q8K243 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim68Q8K243 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim68Q8K243 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim68Q8K243 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim68Q8K243 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim68Q8K243 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim68Q8K243 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim68Q8K243 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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Trim68Q8K243 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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Trim68Q8K243 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim68Q8K243 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim68Q8K243 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim68Q8K243 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim68Q8K243 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim68Q8K243 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim68Q8K243 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim68Q8K243 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim68Q8K243 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim68Q8K243 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim68Q8K243 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim68Q8K243 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim68Q8K243 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim68Q8K243 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim68Q8K243 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim68Q8K243 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim68Q8K243 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim68Q8K243 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim68Q8K243 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim68Q8K243 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim68Q8K243 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim68Q8K243 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim68Q8K243 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim68Q8K243 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim68Q8K243 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim68Q8K243 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim68Q8K243 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim68Q8K243 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim68Q8K243 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
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