Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFK2

Brf1, Transcription factor IIIB 90 kDa subunit, mousemouse

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Length 676 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brf1Q8CFK2 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Brf1Q8CFK2 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Brf1Q8CFK2 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Brf1Q8CFK2 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Brf1Q8CFK2 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Brf1Q8CFK2 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Brf1Q8CFK2 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Brf1Q8CFK2 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Brf1Q8CFK2 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Brf1Q8CFK2 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Brf1Q8CFK2 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Brf1Q8CFK2 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Brf1Q8CFK2 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Brf1Q8CFK2 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Brf1Q8CFK2 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Brf1Q8CFK2 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Brf1Q8CFK2 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Brf1Q8CFK2 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Brf1Q8CFK2 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Brf1Q8CFK2 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Brf1Q8CFK2 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Brf1Q8CFK2 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Brf1Q8CFK2 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Brf1Q8CFK2 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Brf1Q8CFK2 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Brf1Q8CFK2 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Brf1Q8CFK2 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Brf1Q8CFK2 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Brf1Q8CFK2 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Brf1Q8CFK2 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Brf1Q8CFK2 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Brf1Q8CFK2 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Brf1Q8CFK2 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Brf1Q8CFK2 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Brf1Q8CFK2 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Brf1Q8CFK2 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Brf1Q8CFK2 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Brf1Q8CFK2 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Brf1Q8CFK2 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Brf1Q8CFK2 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Brf1Q8CFK2 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Brf1Q8CFK2 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Brf1Q8CFK2 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Brf1Q8CFK2 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Brf1Q8CFK2 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Brf1Q8CFK2 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Brf1Q8CFK2 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Brf1Q8CFK2 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Brf1Q8CFK2 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Brf1Q8CFK2 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Brf1Q8CFK2 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Brf1Q8CFK2 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Brf1Q8CFK2 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Brf1Q8CFK2 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Brf1Q8CFK2 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Brf1Q8CFK2 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Brf1Q8CFK2 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Brf1Q8CFK2 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Brf1Q8CFK2 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Brf1Q8CFK2 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Brf1Q8CFK2 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Brf1Q8CFK2 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Brf1Q8CFK2 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Brf1Q8CFK2 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Brf1Q8CFK2 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Brf1Q8CFK2 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Brf1Q8CFK2 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Brf1Q8CFK2 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Brf1Q8CFK2 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Brf1Q8CFK2 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Brf1Q8CFK2 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Brf1Q8CFK2 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Brf1Q8CFK2 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Brf1Q8CFK2 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Brf1Q8CFK2 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Brf1Q8CFK2 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Brf1Q8CFK2 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Brf1Q8CFK2 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Brf1Q8CFK2 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Brf1Q8CFK2 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Brf1Q8CFK2 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Brf1Q8CFK2 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Brf1Q8CFK2 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Brf1Q8CFK2 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Brf1Q8CFK2 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Brf1Q8CFK2 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Brf1Q8CFK2 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Brf1Q8CFK2 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Brf1Q8CFK2 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Brf1Q8CFK2 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Brf1Q8CFK2 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Brf1Q8CFK2 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Brf1Q8CFK2 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Brf1Q8CFK2 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Brf1Q8CFK2 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Brf1Q8CFK2 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Brf1Q8CFK2 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Brf1Q8CFK2 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Brf1Q8CFK2 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Brf1Q8CFK2 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
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