Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cdkl1Q8CEQ0 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.5 ms