Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBG9

Rnf170, E3 ubiquitin-protein ligase RNF170, mousemouse

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Length 286 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf170Q8CBG9 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf170Q8CBG9 Il6st-201ENSMUST00000070731 5207 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf170Q8CBG9 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf170Q8CBG9 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf170Q8CBG9 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf170Q8CBG9 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf170Q8CBG9 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf170Q8CBG9 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rnf170Q8CBG9 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf170Q8CBG9 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf170Q8CBG9 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf170Q8CBG9 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf170Q8CBG9 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf170Q8CBG9 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf170Q8CBG9 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf170Q8CBG9 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf170Q8CBG9 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf170Q8CBG9 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf170Q8CBG9 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf170Q8CBG9 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf170Q8CBG9 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf170Q8CBG9 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf170Q8CBG9 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf170Q8CBG9 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf170Q8CBG9 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
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Rnf170Q8CBG9 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf170Q8CBG9 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf170Q8CBG9 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf170Q8CBG9 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf170Q8CBG9 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf170Q8CBG9 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf170Q8CBG9 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf170Q8CBG9 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf170Q8CBG9 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf170Q8CBG9 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf170Q8CBG9 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf170Q8CBG9 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf170Q8CBG9 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf170Q8CBG9 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf170Q8CBG9 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf170Q8CBG9 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf170Q8CBG9 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf170Q8CBG9 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf170Q8CBG9 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf170Q8CBG9 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf170Q8CBG9 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf170Q8CBG9 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf170Q8CBG9 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf170Q8CBG9 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf170Q8CBG9 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf170Q8CBG9 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf170Q8CBG9 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf170Q8CBG9 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf170Q8CBG9 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf170Q8CBG9 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf170Q8CBG9 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rnf170Q8CBG9 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rnf170Q8CBG9 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rnf170Q8CBG9 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rnf170Q8CBG9 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rnf170Q8CBG9 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rnf170Q8CBG9 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rnf170Q8CBG9 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rnf170Q8CBG9 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rnf170Q8CBG9 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rnf170Q8CBG9 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rnf170Q8CBG9 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rnf170Q8CBG9 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rnf170Q8CBG9 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rnf170Q8CBG9 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rnf170Q8CBG9 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rnf170Q8CBG9 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rnf170Q8CBG9 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rnf170Q8CBG9 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rnf170Q8CBG9 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rnf170Q8CBG9 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rnf170Q8CBG9 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rnf170Q8CBG9 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rnf170Q8CBG9 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Rnf170Q8CBG9 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Rnf170Q8CBG9 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rnf170Q8CBG9 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rnf170Q8CBG9 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rnf170Q8CBG9 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Rnf170Q8CBG9 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rnf170Q8CBG9 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rnf170Q8CBG9 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rnf170Q8CBG9 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Rnf170Q8CBG9 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rnf170Q8CBG9 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rnf170Q8CBG9 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rnf170Q8CBG9 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Rnf170Q8CBG9 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rnf170Q8CBG9 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rnf170Q8CBG9 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rnf170Q8CBG9 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rnf170Q8CBG9 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rnf170Q8CBG9 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rnf170Q8CBG9 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
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