Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5U9

Ubqln3, Ubiquilin-3, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ubqln3Q8C5U9 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
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Ubqln3Q8C5U9 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
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Ubqln3Q8C5U9 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
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Ubqln3Q8C5U9 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ubqln3Q8C5U9 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
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Ubqln3Q8C5U9 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ubqln3Q8C5U9 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
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Ubqln3Q8C5U9 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ubqln3Q8C5U9 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
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Ubqln3Q8C5U9 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ubqln3Q8C5U9 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
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Ubqln3Q8C5U9 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
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