Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

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Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
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Usp38Q8BW70 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Usp38Q8BW70 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Usp38Q8BW70 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Usp38Q8BW70 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Usp38Q8BW70 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Usp38Q8BW70 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp38Q8BW70 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp38Q8BW70 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp38Q8BW70 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp38Q8BW70 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Usp38Q8BW70 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp38Q8BW70 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Usp38Q8BW70 9430091E24Rik-201ENSMUST00000127301 1067 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Usp38Q8BW70 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Usp38Q8BW70 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Usp38Q8BW70 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Usp38Q8BW70 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Usp38Q8BW70 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Usp38Q8BW70 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp38Q8BW70 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Usp38Q8BW70 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Usp38Q8BW70 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Usp38Q8BW70 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Usp38Q8BW70 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Usp38Q8BW70 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp38Q8BW70 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp38Q8BW70 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Usp38Q8BW70 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp38Q8BW70 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp38Q8BW70 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp38Q8BW70 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp38Q8BW70 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp38Q8BW70 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp38Q8BW70 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp38Q8BW70 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp38Q8BW70 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp38Q8BW70 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp38Q8BW70 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp38Q8BW70 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp38Q8BW70 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp38Q8BW70 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp38Q8BW70 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp38Q8BW70 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp38Q8BW70 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp38Q8BW70 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp38Q8BW70 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
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